CEBPB

CEBPB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GTW, 1GU4, 1GU5, 1H88, 1H89, 1H8A, 1HJB, 1IO4, 2E42, 2E43
Ідентифікатори
Символи	CEBPB, C/EBP-beta, IL6DBP, NF-IL6, TCF5, CCAAT/enhancer binding protein beta, CCAAT enhancer binding protein beta
Зовнішні ІД	OMIM: 189965 MGI: 88373 HomoloGene: 3807 GeneCards: CEBPB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • protein homodimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding; • histone deacetylase binding; • chromatin binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • kinase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • histone acetyltransferase binding; • ubiquitin-like protein ligase binding; • protein heterodimerization activity; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • glucocorticoid receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • nuclear matrix; • CHOP-C/EBP complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • condensed chromosome, centromeric region; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • mammary gland epithelial cell proliferation; • диференціація клітин; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • embryonic placenta development; • пам'ять; • positive regulation of interleukin-4 production; • response to endoplasmic reticulum stress; • mammary gland epithelial cell differentiation; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • negative regulation of T cell proliferation; • liver regeneration; • positive regulation of osteoblast differentiation; • hepatocyte proliferation; • response to lipopolysaccharide; • regulation of osteoclast differentiation; • defense response to bacterium; • acute-phase response; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • neuron differentiation; • cellular response to interleukin-1; • brown fat cell differentiation; • cellular response to amino acid stimulus; • ovarian follicle development; • liver development; • inflammatory response; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of fat cell differentiation; • cellular response to lipopolysaccharide; • fat cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress; • transcription by RNA polymerase II; • granuloma formation; • T-helper 1 cell activation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of odontoblast differentiation; • positive regulation of biomineral tissue development; • positive regulation of sodium-dependent phosphate transport; • positive regulation of inflammatory response; • positive regulation of cold-induced thermogenesis; • regulation of dendritic cell differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1051
	12608
	ENSG00000172216
	ENSMUSG00000056501
	P17676
	P28033
	NM_005194; NM_001285878; NM_001285879
	NM_001287738; NM_001287739; NM_009883
	NP_001272807; NP_001272808; NP_005185
	NP_001274667; NP_001274668; NP_034013
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CEBPB (англ. CCAAT/enhancer binding protein beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот, а молекулярна маса — 36 106^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRLVAWDPA	CLPLPPPPPA	FKSMEVANFY	YEADCLAAAY	GGKAAPAAPP
AARPGPRPPA	GELGSIGDHE	RAIDFSPYLE	PLGAPQAPAP	ATATDTFEAA
PPAPAPAPAS	SGQHHDFLSD	LFSDDYGGKN	CKKPAEYGYV	SLGRLGAAKG
ALHPGCFAPL	HPPPPPPPPP	AELKAEPGFE	PADCKRKEEA	GAPGGGAGMA
AGFPYALRAY	LGYQAVPSGS	SGSLSTSSSS	SPPGTPSPAD	AKAPPTACYA
GAAPAPSQVK	SKAKKTVDKH	SDEYKIRRER	NNIAVRKSRD	KAKMRNLETQ
HKVLELTAEN	ERLQKKVEQL	SRELSTLRNL	FKQLPEPLLA	SSGHC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kinoshita S., Akira S., Kishimoto T. (1992). A member of the C/EBP family, NF-IL6 beta, forms a heterodimer and transcriptionally synergizes with NF-IL6. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1473—1476. PMID 1741402 doi:10.1073/pnas.89.4.1473
Chinery R., Brockman J.A., Dransfield D.T., Coffey R.J. (1997). Antioxidant-induced nuclear translocation of CCAAT/enhancer-binding protein beta. A critical role for protein kinase A-mediated phosphorylation of Ser299. J. Biol. Chem. 272: 30356—30361. PMID 9374525 doi:10.1074/jbc.272.48.30356
Podust L.M., Krezel A.M., Kim Y. (2001). Crystal structure of the CCAAT box/enhancer-binding protein beta activating transcription factor-4 basic leucine zipper heterodimer in the absence of DNA. J. Biol. Chem. 276: 505—513. PMID 11018027 doi:10.1074/jbc.M005594200
Buck M., Poli V., Hunter T., Chojkier M. (2001). C/EBPbeta phosphorylation by RSK creates a functional XEXD caspase inhibitory box critical for cell survival. Mol. Cell. 8: 807—816. PMID 11684016 doi:10.1016/S1097-2765(01)00374-4
Zhu Y., Saunders M.A., Yeh H., Deng W.G., Wu K.K. (2002). Dynamic regulation of cyclooxygenase-2 promoter activity by isoforms of CCAAT/enhancer-binding proteins. J. Biol. Chem. 277: 6923—6928. PMID 11741938 doi:10.1074/jbc.M108075200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1834 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P17676 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1834 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P17676 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]