| TFAP4
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TFAP4, AP-4, bHLHc41, transcription factor AP-4 (activating enhancer binding protein 4), transcription factor AP-4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600743 MGI: 103239 HomoloGene: 2424 GeneCards: TFAP4
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • protein dimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • histone deacetylase binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• transcription repressor complex • клітинне ядро • мітохондрія
|
|---|
| Біологічний процес |
• negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • cellular response to dexamethasone stimulus • negative regulation of DNA binding • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • positive regulation of apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of mitotic cell cycle phase transition • GO:0034622 protein-containing complex assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 16: 4.26 – 4.27 Mb
| Хр. 16: 4.36 – 4.38 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
TFAP4 (англ. Transcription factor AP-4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 38 726[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MEYFMVPTQK
|
|
VPSLQHFRKT
|
|
EKEVIGGLCS
|
|
LANIPLTPET
|
|
QRDQERRIRR
|
| EIANSNERRR
|
|
MQSINAGFQS
|
|
LKTLIPHTDG
|
|
EKLSKAAILQ
|
|
QTAEYIFSLE
|
| QEKTRLLQQN
|
|
TQLKRFIQEL
|
|
SGSSPKRRRA
|
|
EDKDEGIGSP
|
|
DIWEDEKAED
|
| LRREMIELRQ
|
|
QLDKERSVRM
|
|
MLEEQVRSLE
|
|
AHMYPEKLKV
|
|
IAQQVQLQQQ
|
| QEQVRLLHQE
|
|
KLEREQQQLR
|
|
TQLLPPPAPT
|
|
HHPTVIVPAP
|
|
PPPPSHHINV
|
| VTMGPSSVIN
|
|
SVSTSRQNLD
|
|
TIVQAIQHIE
|
|
GTQEKQELEE
|
|
EQRRAVIVKP
|
| VRSCPEAPTS
|
|
DTASDSEASD
|
|
SDAMDQSREE
|
|
PSGDGELP
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|