| CDX2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| CDX2, CDX-3, CDX2/AS, CDX3, caudal type homeobox 2, Cdx2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600297 MGI: 88361 HomoloGene: 968 GeneCards: CDX2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • methyl-CpG binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• transcription repressor complex • нуклеоплазма • condensed nuclear chromosome • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• pattern specification process • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of somitogenesis • somatic stem cell population maintenance • endosome to lysosome transport • placenta development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • labyrinthine layer development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • blood vessel development • trophectodermal cell differentiation • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • positive regulation of cell differentiation • intestinal epithelial cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • animal organ morphogenesis • anterior/posterior axis specification • blastocyst development • anterior/posterior pattern specification
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 13: 27.96 – 27.97 Mb
| Хр. 5: 147.24 – 147.24 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
CDX2 (англ. Caudal type homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 33 520[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MYVSYLLDKD
|
|
VSMYPSSVRH
|
|
SGGLNLAPQN
|
|
FVSPPQYPDY
|
|
GGYHVAAAAA
|
| AAANLDSAQS
|
|
PGPSWPAAYG
|
|
APLREDWNGY
|
|
APGGAAAAAN
|
|
AVAHGLNGGS
|
| PAAAMGYSSP
|
|
ADYHPHHHPH
|
|
HHPHHPAAAP
|
|
SCASGLLQTL
|
|
NPGPPGPAAT
|
| AAAEQLSPGG
|
|
QRRNLCEWMR
|
|
KPAQQSLGSQ
|
|
VKTRTKDKYR
|
|
VVYTDHQRLE
|
| LEKEFHYSRY
|
|
ITIRRKAELA
|
|
ATLGLSERQV
|
|
KIWFQNRRAK
|
|
ERKINKKKLQ
|
| QQQQQQPPQP
|
|
PPPPPQPPQP
|
|
QPGPLRSVPE
|
|
PLSPVSSLQA
|
|
SVPGSVPGVL
|
| GPTGGVLNPT
|
|
VTQ
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|