| HOXA11
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXA11, HOX1, HOX1I, RUSAT1, homeobox A11 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142958 MGI: 96172 HomoloGene: 4033 GeneCards: HOXA11
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • protein-DNA complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis • skeletal system development • proximal/distal pattern formation • regulation of chondrocyte differentiation • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • organ induction • anatomical structure morphogenesis • embryonic digit morphogenesis • transcription, DNA-templated • single fertilization • uterus development • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • branching involved in ureteric bud morphogenesis • developmental growth • embryonic limb morphogenesis • positive regulation of chondrocyte differentiation • Сперматогенез • positive regulation of cell development • регуляція експресії генів • embryonic skeletal joint morphogenesis • metanephros development • mesodermal cell fate specification • dorsal/ventral pattern formation • embryonic forelimb morphogenesis • anterior/posterior pattern specification • bone development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 7: 27.18 – 27.19 Mb
| Хр. 6: 52.22 – 52.22 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXA11 (англ. Homeobox A11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 34 486[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDFDERGPCS
|
|
SNMYLPSCTY
|
|
YVSGPDFSSL
|
|
PSFLPQTPSS
|
|
RPMTYSYSSN
|
| LPQVQPVREV
|
|
TFREYAIEPA
|
|
TKWHPRGNLA
|
|
HCYSAEELVH
|
|
RDCLQAPSAA
|
| GVPGDVLAKS
|
|
SANVYHHPTP
|
|
AVSSNFYSTV
|
|
GRNGVLPQAF
|
|
DQFFETAYGT
|
| PENLASSDYP
|
|
GDKSAEKGPP
|
|
AATATSAAAA
|
|
AAATGAPATS
|
|
SSDSGGGGGC
|
| RETAAAAEEK
|
|
ERRRRPESSS
|
|
SPESSSGHTE
|
|
DKAGGSSGQR
|
|
TRKKRCPYTK
|
| YQIRELEREF
|
|
FFSVYINKEK
|
|
RLQLSRMLNL
|
|
TDRQVKIWFQ
|
|
NRRMKEKKIN
|
| RDRLQYYSAN
|
|
PLL
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Potter S.S., Branford W.W. (1998). Evolutionary conservation and tissue-specific processing of hoxa 11 antisense transcripts. Mamm. Genome. 9: 799—806. PMID 9745033 doi:10.1007/s003359900870
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Thompson A.A., Nguyen L.T. (2000). Amegakaryocytic thrombocytopenia and radio-ulnar synostosis are associated with HOXA11 mutation. Nat. Genet. 26: 397—398. PMID 11101832 doi:10.1038/82511
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|