| ZBTB16
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ZBTB16, PLZF, ZNF145, zinc finger and BTB domain containing 16 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 176797 MGI: 103222 HomoloGene: 21214 GeneCards: ZBTB16
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| conduct disorder[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв’язування з іоном металу • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • nucleic acid binding • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein C-terminus binding • protein domain specific binding • sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• PML body • nuclear speck • ядерні тільця • клітинна мембрана • transcription repressor complex • клітинне ядро • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex • нуклеоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• embryonic hindlimb morphogenesis • forelimb morphogenesis • skeletal system development • myeloid cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic pattern specification • embryonic digit morphogenesis • positive regulation of ossification • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • hindlimb morphogenesis • transcription, DNA-templated • mesonephros development • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • central nervous system development • cartilage development • male germ-line stem cell asymmetric division • positive regulation of cartilage development • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of chondrocyte differentiation • positive regulation of apoptotic process • protein localization to nucleus • positive regulation of NK T cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of fat cell differentiation • negative regulation of myeloid cell differentiation • anterior/posterior pattern specification • negative regulation of cell population proliferation • GO:0097285 апоптоз • посттрансляційна модифікація • кровотворення • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 11: 114.06 – 114.26 Mb
| Хр. 9: 48.57 – 48.75 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
ZBTB16 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 673 амінокислот, а молекулярна маса — 74 274[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDLTKMGMIQ
|
|
LQNPSHPTGL
|
|
LCKANQMRLA
|
|
GTLCDVVIMV
|
|
DSQEFHAHRT
|
| VLACTSKMFE
|
|
ILFHRNSQHY
|
|
TLDFLSPKTF
|
|
QQILEYAYTA
|
|
TLQAKAEDLD
|
| DLLYAAEILE
|
|
IEYLEEQCLK
|
|
MLETIQASDD
|
|
NDTEATMADG
|
|
GAEEEEDRKA
|
| RYLKNIFISK
|
|
HSSEESGYAS
|
|
VAGQSLPGPM
|
|
VDQSPSVSTS
|
|
FGLSAMSPTK
|
| AAVDSLMTIG
|
|
QSLLQGTLQP
|
|
PAGPEEPTLA
|
|
GGGRHPGVAE
|
|
VKTEMMQVDE
|
| VPSQDSPGAA
|
|
ESSISGGMGD
|
|
KVEERGKEGP
|
|
GTPTRSSVIT
|
|
SARELHYGRE
|
| ESAEQVPPPA
|
|
EAGQAPTGRP
|
|
EHPAPPPEKH
|
|
LGIYSVLPNH
|
|
KADAVLSMPS
|
| SVTSGLHVQP
|
|
ALAVSMDFST
|
|
YGGLLPQGFI
|
|
QRELFSKLGE
|
|
LAVGMKSESR
|
| TIGEQCSVCG
|
|
VELPDNEAVE
|
|
QHRKLHSGMK
|
|
TYGCELCGKR
|
|
FLDSLRLRMH
|
| LLAHSAGAKA
|
|
FVCDQCGAQF
|
|
SKEDALETHR
|
|
QTHTGTDMAV
|
|
FCLLCGKRFQ
|
| AQSALQQHME
|
|
VHAGVRSYIC
|
|
SECNRTFPSH
|
|
TALKRHLRSH
|
|
TGDHPYECEF
|
| CGSCFRDEST
|
|
LKSHKRIHTG
|
|
EKPYECNGCG
|
|
KKFSLKHQLE
|
|
THYRVHTGEK
|
| PFECKLCHQR
|
|
SRDYSAMIKH
|
|
LRTHNGASPY
|
|
QCTICTEYCP
|
|
SLSSMQKHMK
|
| GHKPEEIPPD
|
|
WRIEKTYLYL
|
|
CYV
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Furukawa M., He Y.J., Borchers C., Xiong Y. (2003). Targeting of protein ubiquitination by BTB-Cullin 3-Roc1 ubiquitin ligases. Nat. Cell Biol. 5: 1001—1007. PMID 14528312 doi:10.1038/ncb1056
- Ahmad K.F., Engel C.K., Prive G.G. (1998). Crystal structure of the BTB domain from PLZF. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 12123—12128. PMID 9770450 doi:10.1073/pnas.95.21.12123
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|