| MTF1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| MTF1, MTF-1, ZRF, metal-regulatory transcription factor 1, metal regulatory transcription factor 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600172 MGI: 101786 HomoloGene: 4347 GeneCards: MTF1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| гіпотиреоз[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• response to cadmium ion • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to metal ion • GO:0001306 response to oxidative stress • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • central nervous system development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 37.81 – 37.86 Mb
| Хр. 4: 124.7 – 124.74 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
MTF1 (англ. Metal regulatory transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот, а молекулярна маса — 80 957[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MGEHSPDNNI
|
|
IYFEAEEDEL
|
|
TPDDKMLRFV
|
|
DKNGLVPSSS
|
|
GTVYDRTTVL
|
| IEQDPGTLED
|
|
EDDDGQCGEH
|
|
LPFLVGGEEG
|
|
FHLIDHEAMS
|
|
QGYVQHIISP
|
| DQIHLTINPG
|
|
STPMPRNIEG
|
|
ATLTLQSECP
|
|
ETKRKEVKRY
|
|
QCTFEGCPRT
|
| YSTAGNLRTH
|
|
QKTHRGEYTF
|
|
VCNQEGCGKA
|
|
FLTSYSLRIH
|
|
VRVHTKEKPF
|
| ECDVQGCEKA
|
|
FNTLYRLKAH
|
|
QRLHTGKTFN
|
|
CESEGCSKYF
|
|
TTLSDLRKHI
|
| RTHTGEKPFR
|
|
CDHDGCGKAF
|
|
AASHHLKTHV
|
|
RTHTGERPFF
|
|
CPSNGCEKTF
|
| STQYSLKSHM
|
|
KGHDNKGHSY
|
|
NALPQHNGSE
|
|
DTNHSLCLSD
|
|
LSLLSTDSEL
|
| RENSSTTQGQ
|
|
DLSTISPAII
|
|
FESMFQNSDD
|
|
TAIQEDPQQT
|
|
ASLTESFNGD
|
| AESVSDVPPS
|
|
TGNSASLSLP
|
|
LVLQPGLSEP
|
|
PQPLLPASAP
|
|
SAPPPAPSLG
|
| PGSQQAAFGN
|
|
PPALLQPPEV
|
|
PVPHSTQFAA
|
|
NHQEFLPHPQ
|
|
APQPIVPGLS
|
| VVAGASASAA
|
|
AVASAVAAPA
|
|
PPQSTTEPLP
|
|
AMVQTLPLGA
|
|
NSVLTNNPTI
|
| TITPTPNTAI
|
|
LQSSLVMGEQ
|
|
NLQWILNGAT
|
|
SSPQNQEQIQ
|
|
QASKVEKVFF
|
| TTAVPVASSP
|
|
GSSVQQIGLS
|
|
VPVIIIKQEE
|
|
ACQCQCACRD
|
|
SAKERASSRR
|
| KGCSSPPPPE
|
|
PSPQAPDGPS
|
|
LQLPAQTFSS
|
|
APVPGSSSST
|
|
LPSSCEQSRQ
|
| AETPSDPQTE
|
|
TLSAMDVSEF
|
|
LSLQSLDTPS
|
|
NLIPIEALLQ
|
|
GEEEMGLTSS
|
| FSK
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|