| FOXA2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXA2, HNF3B, TCF3B, forkhead box A2, HNF-3-beta |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600288 MGI: 1347476 HomoloGene: 7762 GeneCards: FOXA2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• dopaminergic neuron differentiation • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of gastrulation • response to interleukin-6 • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cell fate specification • adult locomotory behavior • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • negative regulation of glucokinase activity • negative regulation of detection of glucose • regulation of blood coagulation • positive regulation of embryonic development • primitive streak formation • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • endocrine pancreas development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin • anatomical structure morphogenesis • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose • диференціація клітин
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 20: 22.58 – 22.59 Mb
| Хр. 2: 147.88 – 147.89 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXA2 (англ. Forkhead box A2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 48 306[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLGAVKMEGH
|
|
EPSDWSSYYA
|
|
EPEGYSSVSN
|
|
MNAGLGMNGM
|
|
NTYMSMSAAA
|
| MGSGSGNMSA
|
|
GSMNMSSYVG
|
|
AGMSPSLAGM
|
|
SPGAGAMAGM
|
|
GGSAGAAGVA
|
| GMGPHLSPSL
|
|
SPLGGQAAGA
|
|
MGGLAPYANM
|
|
NSMSPMYGQA
|
|
GLSRARDPKT
|
| YRRSYTHAKP
|
|
PYSYISLITM
|
|
AIQQSPNKML
|
|
TLSEIYQWIM
|
|
DLFPFYRQNQ
|
| QRWQNSIRHS
|
|
LSFNDCFLKV
|
|
PRSPDKPGKG
|
|
SFWTLHPDSG
|
|
NMFENGCYLR
|
| RQKRFKCEKQ
|
|
LALKEAAGAA
|
|
GSGKKAAAGA
|
|
QASQAQLGEA
|
|
AGPASETPAG
|
| TESPHSSASP
|
|
CQEHKRGGLG
|
|
ELKGTPAAAL
|
|
SPPEPAPSPG
|
|
QQQQAAAHLL
|
| GPPHHPGLPP
|
|
EAHLKPEHHY
|
|
AFNHPFSINN
|
|
LMSSEQQHHH
|
|
SHHHHQPHKM
|
| DLKAYEQVMH
|
|
YPGYGSPMPG
|
|
SLAMGPVTNK
|
|
TGLDASPLAA
|
|
DTSYYQGVYS
|
| RPIMNSS
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Wolfrum C., Besser D., Luca E., Stoffel M. (2003). Insulin regulates the activity of forkhead transcription factor Hnf-3beta/Foxa-2 by Akt-mediated phosphorylation and nuclear/cytosolic localization. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 11624—11629. PMID 14500912 doi:10.1073/pnas.1931483100
- Verschuur M., de Jong M., Felida L., de Maat M.P., Vos H.L. (2005). A hepatocyte nuclear factor-3 site in the fibrinogen beta promoter is important for interleukin 6-induced expression, and its activity is influenced by the adjacent -148C/T polymorphism. J. Biol. Chem. 280: 16763—16771. PMID 15737987 doi:10.1074/jbc.M501973200
Примітки
Див. також
Посилання
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|