| HLX
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HLX, HB24, HLX1, H2.0 like homeobox |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142995 MGI: 96109 HomoloGene: 7363 GeneCards: HLX
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• negative regulation of T-helper 2 cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • enteric nervous system development • positive regulation of organ growth • positive regulation of cell population proliferation • skeletal muscle tissue development • диференціація клітин • liver development • positive regulation of T-helper 1 cell differentiation • transcription, DNA-templated • embryonic digestive tract morphogenesis • animal organ development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 220.88 – 220.89 Mb
| Хр. 1: 184.46 – 184.46 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HLX (англ. H2.0 like homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 488 амінокислот, а молекулярна маса — 50 789[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MFAAGLAPFY
|
|
ASNFSLWSAA
|
|
YCSSAGPGGC
|
|
SFPLDPAAVK
|
|
KPSFCIADIL
|
| HAGVGDLGAA
|
|
PEGLAGASAA
|
|
ALTAHLGSVH
|
|
PHASFQAAAR
|
|
SPLRPTPVVA
|
| PSEVPAGFPQ
|
|
RLSPLSAAYH
|
|
HHHPQQQQQQ
|
|
QQPQQQQPPP
|
|
PPRAGALQPP
|
| ASGTRVVPNP
|
|
HHSGSAPAPS
|
|
SKDLKFGIDR
|
|
ILSAEFDPKV
|
|
KEGNTLRDLT
|
| SLLTGGRPAG
|
|
VHLSGLQPSA
|
|
GQFFASLDPI
|
|
NEASAILSPL
|
|
NSNPRNSVQH
|
| QFQDTFPGPY
|
|
AVLTKDTMPQ
|
|
TYKRKRSWSR
|
|
AVFSNLQRKG
|
|
LEKRFEIQKY
|
| VTKPDRKQLA
|
|
AMLGLTDAQV
|
|
KVWFQNRRMK
|
|
WRHSKEAQAQ
|
|
KDKDKEAGEK
|
| PSGGAPAADG
|
|
EQDERSPSRS
|
|
EGEAESESSD
|
|
SESLDMAPSD
|
|
TERTEGSERS
|
| LHQTTVIKAP
|
|
VTGALITASS
|
|
AGSGGSSGGG
|
|
GNSFSFSSAS
|
|
SLSSSSTSAG
|
| CASSLGGGGA
|
|
SELLPATQPT
|
|
ASSAPKSPEP
|
|
AQGALGCL
|
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Kennedy M.A., Rayner J.C., Morris C.M. (1994). Genomic structure, promoter sequence, and revised translation of human homeobox gene HLX1. Genomics. 22: 348—355. PMID 7806220 doi:10.1006/geno.1994.1394
- Nishimura D.Y., Purchio A.F., Murray J.C. (1993). Linkage localization of TGFB2 and the human homeobox gene HLX1 to chromosome 1q. Genomics. 15: 357—364. PMID 8095486 doi:10.1006/geno.1993.1068
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|