| NR2F2
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| NR2F2, ARP1, CHTD4, COUPTFB, COUPTFII, NF-E3, NR2F1, SVP40, TFCOUP2, COUP-TFII, nuclear receptor subfamily 2 group F member 2, COUPTF2, ARP-1, SRXX5 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 107773 MGI: 1352452 HomoloGene: 7628 GeneCards: NR2F2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • retinoic acid binding • protein homodimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв’язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• trophoblast giant cell differentiation • response to estradiol • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • Обмін жирів • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • placenta blood vessel development • radial pattern formation • neuron migration • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • lymph vessel development • transcription, DNA-templated • negative regulation of endothelial cell migration • limb development • negative regulation of endothelial cell proliferation • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • maternal placenta development • запліднення • forebrain development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • skeletal muscle tissue development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • anterior/posterior pattern specification • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • positive regulation of systemic arterial blood pressure
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 15: 96.33 – 96.34 Mb
| Хр. 7: 70 – 70.02 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
NR2F2 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group F member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 45 571[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAMVVSTWRD
|
|
PQDEVPGSQG
|
|
SQASQAPPVP
|
|
GPPPGAPHTP
|
|
QTPGQGGPAS
|
| TPAQTAAGGQ
|
|
GGPGGPGSDK
|
|
QQQQQHIECV
|
|
VCGDKSSGKH
|
|
YGQFTCEGCK
|
| SFFKRSVRRN
|
|
LSYTCRANRN
|
|
CPIDQHHRNQ
|
|
CQYCRLKKCL
|
|
KVGMRREAVQ
|
| RGRMPPTQPT
|
|
HGQFALTNGD
|
|
PLNCHSYLSG
|
|
YISLLLRAEP
|
|
YPTSRFGSQC
|
| MQPNNIMGIE
|
|
NICELAARML
|
|
FSAVEWARNI
|
|
PFFPDLQITD
|
|
QVALLRLTWS
|
| ELFVLNAAQC
|
|
SMPLHVAPLL
|
|
AAAGLHASPM
|
|
SADRVVAFMD
|
|
HIRIFQEQVE
|
| KLKALHVDSA
|
|
EYSCLKAIVL
|
|
FTSDACGLSD
|
|
VAHVESLQEK
|
|
SQCALEEYVR
|
| SQYPNQPTRF
|
|
GKLLLRLPSL
|
|
RTVSSSVIEQ
|
|
LFFVRLVGKT
|
|
PIETLIRDML
|
| LSGSSFNWPY
|
|
MAIQ
|
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Ladias J.A.A., Karathanasis S.K. (1991). Regulation of the apolipoprotein AI gene by ARP-1, a novel member of the steroid receptor superfamily. Science. 251: 561—565. PMID 1899293 doi:10.1126/science.1899293
- Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 doi:10.1016/j.febslet.2008.07.003
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Chu K., Zingg H.H. (1997). The nuclear orphan receptors COUP-TFII and Ear-2 act as silencers of the human oxytocin gene promoter. J. Mol. Endocrinol. 19: 163—172. PMID 9343308 doi:10.1677/jme.0.0190163
- Wang L.H., Ing N.H., Tsai S.Y., O'Malley B.W., Tsai M.J. (1991). The COUP-TFs compose a family of functionally related transcription factors. Gene Expr. 1: 207—216. PMID 1820218
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|