| PAX4
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| PAX4, KPD, MODY9, paired box 4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 167413 MGI: 97488 HomoloGene: 4515 GeneCards: PAX4
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| цукровий діабет 1-го типу, maturity-onset diabetes of the young type 9[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • retina development in camera-type eye • циркадний ритм • positive regulation of cell differentiation • animal organ morphogenesis • регуляція диференціювання клітин • response to cAMP • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • endocrine pancreas development • pancreas development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 7: 127.61 – 127.62 Mb
| Хр. 6: 28.44 – 28.45 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
PAX4 (англ. Paired box 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350 амінокислот, а молекулярна маса — 37 833[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MHQDGISSMN
|
|
QLGGLFVNGR
|
|
PLPLDTRQQI
|
|
VRLAVSGMRP
|
|
CDISRILKVS
|
| NGCVSKILGR
|
|
YYRTGVLEPK
|
|
GIGGSKPRLA
|
|
TPPVVARIAQ
|
|
LKGECPALFA
|
| WEIQRQLCAE
|
|
GLCTQDKTPS
|
|
VSSINRVLRA
|
|
LQEDQGLPCT
|
|
RLRSPAVLAP
|
| AVLTPHSGSE
|
|
TPRGTHPGTG
|
|
HRNRTIFSPS
|
|
QAEALEKEFQ
|
|
RGQYPDSVAR
|
| GKLATATSLP
|
|
EDTVRVWFSN
|
|
RRAKWRRQEK
|
|
LKWEMQLPGA
|
|
SQGLTVPRVA
|
| PGIISAQQSP
|
|
GSVPTAALPA
|
|
LEPLGPSCYQ
|
|
LCWATAPERC
|
|
LSDTPPKACL
|
| KPCWDCGSFL
|
|
LPVIAPSCVD
|
|
VAWPCLDASL
|
|
AHHLIGGAGK
|
|
ATPTHFSHWP
|
|
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|