HOXB1

HOXB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1B72
Ідентифікатори
Символи	HOXB1, HCFP3, HOX2, HOX2I, Hox-2.9, homeobox B1
Зовнішні ІД	OMIM: 142968 MGI: 96182 HomoloGene: 1615 GeneCards: HOXB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • protein domain specific binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • pattern specification process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • anatomical structure morphogenesis; • anterior/posterior pattern specification; • rhombomere development; • rhombomere 4 development; • rhombomere 5 development; • facial nerve structural organization; • facial nucleus development; • anatomical structure formation involved in morphogenesis; • embryonic skeletal system morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3211
	15407
	ENSG00000120094
	ENSMUSG00000018973
	P14653
	P17919
	NM_002144
	NM_008266
	NP_002135
	NP_032292
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXB1 (англ. Homeobox B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 32 193^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M D Y N R M N S F L	E Y P L C N R G P S	A Y S A H S A P T S	F P P S S A Q A V D	S Y A S E G R Y G G
G L S S P A F Q Q N	S G Y P A Q Q P P S	T L G V P F P S S A	P S G Y A P A A C S	P S Y G P S Q Y Y P
L G Q S E G D G G Y	F H P S S Y G A Q L	G G L S D G Y G A G	G A G P G P Y P P Q	H P P Y G N E Q T A
S F A P A Y A D L L	S E D K E T P C P S	E P N T P T A R T F	D W M K V K R N P P	K T A K V S E P G L
G S P S G L R T N F	T T R Q L T E L E K	E F H F N K Y L S R	A R R V E I A A T L	E L N E T Q V K I W
F Q N R R M K Q K K	R E R E E G R V P P	A P P G C P K E A A	G D A S D Q S T C T	S P E A S P S S V T
S

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Piper D.E., Batchelor A.H., Chang C.-P., Cleary M.L., Wolberger C. (1999). Structure of a HoxB1-Pbx1 heterodimer bound to DNA: role of the hexapeptide and a fourth homeodomain helix in complex formation. Cell. 96: 587—597. PMID 10052460 doi:10.1016/s0092-8674(00)80662-5

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5111 (англ.) . Архів оригіналу за 8 липня 2017. Процитовано 10 березня 2020. [Архівовано 2017-07-08 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P14653 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2020. Процитовано 10 березня 2020.

Див. також

Хромосома 17

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5111 (англ.) . Архів оригіналу за 8 липня 2017. Процитовано 10 березня 2020. [Архівовано 2017-07-08 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P14653 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2020. Процитовано 10 березня 2020.

[1]

[2]

[3]

[4]