HBP1

HBP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2E6O, 3QVE
Ідентифікатори
Символи	HBP1, HMG-box transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 616714 MGI: 894659 HomoloGene: 8171 GeneCards: HBP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • nuclear speck;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • Wnt; • transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	26959
	73389
	ENSG00000105856; ENSG00000283847
	ENSMUSG00000002996
	O60381
	Q8R316
	NM_001244262; NM_012257
	NM_153198; NM_177993; NM_001361928
	NP_001231191; NP_036389
	NP_694878; NP_818774; NP_001348857
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HBP1 (англ. HMG-box transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 514 амінокислот, а молекулярна маса — 57 645^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVWEVKTNQM	PNAVQKLLLV	MDKRASGMND	SLELLQCNEN	LPSSPGYNSC
DEHMELDDLP	ELQAVQSDPT	QSGMYQLSSD	VSHQEYPRSS	WNQNTSDIPE
TTYRENEVDW	LTELANIATS	PQSPLMQCSF	YNRSSPVHII	ATSKSLHSYA
RPPPVSSSSK	SEPAFPHHHW	KEETPVRHER	ANSESESGIF	CMSSLSDDDD
LGWCNSWPST	VWHCFLKGTR	LCFHKGSNKE	WQDVEDFARA	EGCDNEEDLQ
MGIHKGYGSD	GLKLLSHEES	VSFGESVLKL	TFDPGTVEDG	LLTVECKLDH
PFYVKNKGWS	SFYPSLTVVQ	HGIPCCEVHI	GDVCLPPGHP	DAINFDDSGV
FDTFKSYDFT	PMDSSAVYVL	SSMARQRRAS	LSCGGPGGQD	FARSGFSKNC
GSPGSSQLSS	NSLYAKAVKN	HSSGTVSATS	PNKCKRPMNA	FMLFAKKYRV
EYTQMYPGKD	NRAISVILGD	RWKKMKNEER	RMYTLEAKAL	AEEQKRLNPD
CWKRKRTNSG	SQQH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23200 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O60381 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23200 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O60381 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]