REST (ген)

REST
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CZY
Ідентифікатори
Символи	REST, Rest, 2610008J04Rik, AA407358, NRSF, XBR, REST4, WT6, RE1 silencing transcription factor, GINGF5, HGF5, DFNA27
Зовнішні ІД	OMIM: 600571 MGI: 104897 HomoloGene: 4099 GeneCards: REST
Пов'язані генетичні захворювання
	gingival fibromatosis 5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • outward rectifier potassium channel activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding; • зв’язування з іоном металу; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase activity; • chromatin binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • нуклеоплазма; • transcription repressor complex; • клітинне ядро; • цитоплазма; • histone methyltransferase complex;
Біологічний процес	• cellular response to electrical stimulus; • negative regulation of dense core granule biogenesis; • negative regulation of insulin secretion; • negative regulation of cortisol biosynthetic process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of amniotic stem cell differentiation; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • negative regulation of mesenchymal stem cell differentiation; • histone H4 deacetylation; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • cellular response to glucocorticoid stimulus; • negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell population proliferation; • negative regulation of aldosterone biosynthetic process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • cardiac muscle cell myoblast differentiation; • negative regulation of neurogenesis; • potassium ion transmembrane transport; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of apoptotic process; • negative regulation of neuron differentiation; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • response to hypoxia; • регуляція експресії генів; • positive regulation of neuron differentiation; • regulation of osteoblast differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5978
	19712
	ENSG00000084093
	ENSMUSG00000029249
	Q13127
	Q8VIG1
	NM_001193508; NM_005612; NM_001363453
	NM_011263
	NP_001180437; NP_005603; NP_001350382
	NP_035393
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

REST (англ. RE1 silencing transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 097 амінокислот, а молекулярна маса — 121 872^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATQVMGQSS	GGGGLFTSSG	NIGMALPNDM	YDLHDLSKAE	LAAPQLIMLA
NVALTGEVNG	SCCDYLVGEE	RQMAELMPVG	DNNFSDSEEG	EGLEESADIK
GEPHGLENME	LRSLELSVVE	PQPVFEASGA	PDIYSSNKDL	PPETPGAEDK
GKSSKTKPFR	CKPCQYEAES	EEQFVHHIRV	HSAKKFFVEE	SAEKQAKARE
SGSSTAEEGD	FSKGPIRCDR	CGYNTNRYDH	YTAHLKHHTR	AGDNERVYKC
IICTYTTVSE	YHWRKHLRNH	FPRKVYTCGK	CNYFSDRKNN	YVQHVRTHTG
ERPYKCELCP	YSSSQKTHLT	RHMRTHSGEK	PFKCDQCSYV	ASNQHEVTRH
ARQVHNGPKP	LNCPHCDYKT	ADRSNFKKHV	ELHVNPRQFN	CPVCDYAASK
KCNLQYHFKS	KHPTCPNKTM	DVSKVKLKKT	KKREADLPDN	ITNEKTEIEQ
TKIKGDVAGK	KNEKSVKAEK	RDVSKEKKPS	NNVSVIQVTT	RTRKSVTEVK
EMDVHTGSNS	EKFSKTKKSK	RKLEVDSHSL	HGPVNDEESS	TKKKKKVESK
SKNNSQEVPK	GDSKVEENKK	QNTCMKKSTK	KKTLKNKSSK	KSSKPPQKEP
VEKGSAQMDP	PQMGPAPTEA	VQKGPVQVEP	PPPMEHAQME	GAQIRPAPDE
PVQMEVVQEG	PAQKELLPPV	EPAQMVGAQI	VLAHMELPPP	METAQTEVAQ
MGPAPMEPAQ	MEVAQVESAP	MQVVQKEPVQ	MELSPPMEVV	QKEPVQIELS
PPMEVVQKEP	VKIELSPPIE	VVQKEPVQME	LSPPMGVVQK	EPAQREPPPP
REPPLHMEPI	SKKPPLRKDK	KEKSNMQSER	ARKEQVLIEV	GLVPVKDSWL
LKESVSTEDL	SPPSPPLPKE	NLREEASGDQ	KLLNTGEGNK	EAPLQKVGAE
EADESLPGLA	ANINESTHIS	SSGQNLNTPE	GETLNGKHQT	DSIVCEMKMD
TDQNTRENLT	GINSTVEEPV	SPMLPPSAVE	EREAVSKTAL	ASPPATMAAN
ESQEIDEDEG	IHSHEGSDLS	DNMSEGSDDS	GLHGARPVPQ	ESSRKNAKEA
LAVKAAKGDF	VCIFCDRSFR	KGKDYSKHLN	RHLVNVYYLE	EAAQGQE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Schoenherr C.J., Anderson D.J. (1995). The neuron-restrictive silencer factor (NRSF): a coordinate repressor of multiple neuron-specific genes. Science. 267: 1360—1363. PMID 7871435 doi:10.1126/science.7871435
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Palm K., Metsis M., Timmusk T. (1999). Neuron-specific splicing of zinc finger transcription factor REST/NRSF/XBR is frequent in neuroblastomas and conserved in human, mouse and rat. Brain Res. Mol. Brain Res. 72: 30—39. PMID 10521596 doi:10.1016/S0169-328X(99)00196-5
Nomura M., Uda-Tochio H., Murai K., Mori N., Nishimura Y. (2005). The neural repressor NRSF/REST binds the PAH1 domain of the Sin3 corepressor by using its distinct short hydrophobic helix. J. Mol. Biol. 354: 903—915. PMID 16288918 doi:10.1016/j.jmb.2005.10.008
Scholl T., Stevens M.B., Mahanta S., Strominger J.L. (1996). A zinc finger protein that represses transcription of the human MHC class II gene, DPA. J. Immunol. 156: 1448—1457. PMID 8568247

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з REST переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9966 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13127 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

[1] Захворювання, генетично пов'язані з REST переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9966 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q13127 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]