| DLX3
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| DLX3, AI4, TDO, AV237891, Dlx-3, distal-less homeobox 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600525 MGI: 94903 HomoloGene: 74544 GeneCards: DLX3
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| tricho–dento–osseous syndrome, amelogenesis imperfecta type 4[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • placenta development • blood vessel development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • odontoblast differentiation • odontogenesis of dentin-containing tooth • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • epithelial cell differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 49.99 – 50 Mb
| Хр. 11: 95.01 – 95.02 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
DLX3 (англ. Distal-less homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 287 амінокислот, а молекулярна маса — 31 738[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSGSFDRKLS
|
|
SILTDISSSL
|
|
SCHAGSKDSP
|
|
TLPESSVTDL
|
|
GYYSAPQHDY
|
| YSGQPYGQTV
|
|
NPYTYHHQFN
|
|
LNGLAGTGAY
|
|
SPKSEYTYGA
|
|
SYRQYGAYRE
|
| QPLPAQDPVS
|
|
VKEEPEAEVR
|
|
MVNGKPKKVR
|
|
KPRTIYSSYQ
|
|
LAALQRRFQK
|
| AQYLALPERA
|
|
ELAAQLGLTQ
|
|
TQVKIWFQNR
|
|
RSKFKKLYKN
|
|
GEVPLEHSPN
|
| NSDSMACNSP
|
|
PSPALWDTSS
|
|
HSTPAPARSQ
|
|
LPPPLPYSAS
|
|
PSYLDDPTNS
|
| WYHAQNLSGP
|
|
HLQQQPPQPA
|
|
TLHHASPGPP
|
|
PNPGAVY
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Price J.A., Bowden D.W., Wright J.T., Pettenati M.J., Hart T.C. (1998). Identification of a mutation in DLX3 associated with tricho-dento-osseous (TDO) syndrome. Hum. Mol. Genet. 7: 563—569. PMID 9467018 doi:10.1093/hmg/7.3.563
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|