| HSF4
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HSF4, CTM, CTRCT5, heat shock transcription factor 4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602438 MGI: 1347058 HomoloGene: 100128 GeneCards: HSF4
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| cataract 5 multiple types[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein phosphatase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • nuclear speck
|
|---|
| Біологічний процес |
• розвиток ока • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • розвиток клітин • histone H3-K9 demethylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • protein homotrimerization • positive regulation of cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • camera-type eye development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • protein homooligomerization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • зріння (видіннє) • cellular response to heat • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to heat stress
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 16: 67.16 – 67.17 Mb
| Хр. 8: 106 – 106 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
HSF4 (англ. Heat shock transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 492 амінокислот, а молекулярна маса — 53 011[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQEAPAALPT
|
|
EPGPSPVPAF
|
|
LGKLWALVGD
|
|
PGTDHLIRWS
|
|
PSGTSFLVSD
|
| QSRFAKEVLP
|
|
QYFKHSNMAS
|
|
FVRQLNMYGF
|
|
RKVVSIEQGG
|
|
LLRPERDHVE
|
| FQHPSFVRGR
|
|
EQLLERVRRK
|
|
VPALRGDDGR
|
|
WRPEDLGRLL
|
|
GEVQALRGVQ
|
| ESTEARLREL
|
|
RQQNEILWRE
|
|
VVTLRQSHGQ
|
|
QHRVIGKLIQ
|
|
CLFGPLQAGP
|
| SNAGGKRKLS
|
|
LMLDEGSSCP
|
|
TPAKFNTCPL
|
|
PGALLQDPYF
|
|
IQSPLPETNL
|
| GLSPHRARGP
|
|
IISDIPEDSP
|
|
SPEGTRLSPS
|
|
SDGRREKGLA
|
|
LLKEEPASPG
|
| GDGEAGLALA
|
|
PNECDFCVTA
|
|
PPPLPVAVVQ
|
|
AILEGKGSFS
|
|
PEGPRNAQQP
|
| EPGDPREIPD
|
|
RGPLGLESGD
|
|
RSPESLLPPM
|
|
LLQPPQESVE
|
|
PAGPLDVLGP
|
| SLQGREWTLM
|
|
DLDMELSLMQ
|
|
PLVPERGEPE
|
|
LAVKGLNSPS
|
|
PGKDPTLGAP
|
| LLLDVQAALG
|
|
GPALGLPGAL
|
|
TIYSTPESRT
|
|
ASYLGPEASP
|
|
SP
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|