| NR2E1
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| NR2E1, TLL, TLX, XTLL, nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 603849 MGI: 1100526 HomoloGene: 37750 GeneCards: NR2E1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • зв’язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • enzyme binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• glial cell migration • cell fate commitment • negative regulation of astrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • somatic stem cell population maintenance • dentate gyrus development • negative regulation of neural precursor cell proliferation • regulation of cellular component organization • extracellular matrix organization • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • behavioral fear response • regulation of timing of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • positive regulation of angiogenesis • anterior commissure morphogenesis • regulation of dendrite morphogenesis • positive regulation of neural precursor cell proliferation • multicellular organism development • brain development • positive regulation of cell cycle • amygdala development • retina development in camera-type eye • forebrain generation of neurons • layer formation in cerebral cortex • positive regulation of cell population proliferation • cerebral cortex development • соціальна поведінка • cerebral cortex neuron differentiation • regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • camera-type eye development • olfactory bulb development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of stem cell proliferation • aggressive behavior • зріння (видіннє) • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • довготривала потенціація
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 108.17 – 108.19 Mb
| Хр. 10: 42.44 – 42.46 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
NR2E1 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 42 589[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSKPAGSTSR
|
|
ILDIPCKVCG
|
|
DRSSGKHYGV
|
|
YACDGCSGFF
|
|
KRSIRRNRTY
|
| VCKSGNQGGC
|
|
PVDKTHRNQC
|
|
RACRLKKCLE
|
|
VNMNKDAVQH
|
|
ERGPRTSTIR
|
| KQVALYFRGH
|
|
KEENGAAAHF
|
|
PSAALPAPAF
|
|
FTAVTQLEPH
|
|
GLELAAVSTT
|
| PERQTLVSLA
|
|
QPTPKYPHEV
|
|
NGTPMYLYEV
|
|
ATESVCESAA
|
|
RLLFMSIKWA
|
| KSVPAFSTLS
|
|
LQDQLMLLED
|
|
AWRELFVLGI
|
|
AQWAIPVDAN
|
|
TLLAVSGMNG
|
| DNTDSQKLNK
|
|
IISEIQALQE
|
|
VVARFRQLRL
|
|
DATEFACLKC
|
|
IVTFKAVPTH
|
| SGSELRSFRN
|
|
AAAIAALQDE
|
|
AQLTLNSYIH
|
|
TRYPTQPCRF
|
|
GKLLLLLPAL
|
| RSISPSTIEE
|
|
VFFKKTIGNV
|
|
PITRLLSDMY
|
|
KSSDI
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|