REL

REL
Ідентифікатори
Символи	REL, C-Rel, REL proto-oncogene, NF-kB subunit, HIVEN86A, IMD92
Зовнішні ІД	OMIM: 164910 MGI: 97897 HomoloGene: 2182 GeneCards: REL
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит, psoriatic arthritis
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • I-kappaB/NF-kappaB complex; • transcription regulator complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• response to cytokine; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of interferon-beta production; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • NIK/NF-kappaB signaling; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • вроджений імунітет; • inflammatory response; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of neuron death; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5966
	19696
	ENSG00000162924
	ENSMUSG00000020275
	Q04864
	P15307
	NM_001291746; NM_002908
	NM_009044
	NP_001278675; NP_002899
	NP_033070
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

REL (англ. REL proto-oncogene, NF-kB subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 68 520^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASGAYNPYI	EIIEQPRQRG	MRFRYKCEGR	SAGSIPGEHS	TDNNRTYPSI
QIMNYYGKGK	VRITLVTKND	PYKPHPHDLV	GKDCRDGYYE	AEFGQERRPL
FFQNLGIRCV	KKKEVKEAII	TRIKAGINPF	NVPEKQLNDI	EDCDLNVVRL
CFQVFLPDEH	GNLTTALPPV	VSNPIYDNRA	PNTAELRICR	VNKNCGSVRG
GDEIFLLCDK	VQKDDIEVRF	VLNDWEAKGI	FSQADVHRQV	AIVFKTPPYC
KAITEPVTVK	MQLRRPSDQE	VSESMDFRYL	PDEKDTYGNK	AKKQKTTLLF
QKLCQDHVET	GFRHVDQDGL	ELLTSGDPPT	LASQSAGITV	NFPERPRPGL
LGSIGEGRYF	KKEPNLFSHD	AVVREMPTGV	SSQAESYYPS	PGPISSGLSH
HASMAPLPSS	SWSSVAHPTP	RSGNTNPLSS	FSTRTLPSNS	QGIPPFLRIP
VGNDLNASNA	CIYNNADDIV	GMEASSMPSA	DLYGISDPNM	LSNCSVNMMT
TSSDSMGETD	NPRLLSMNLE	NPSCNSVLDP	RDLRQLHQMS	SSSMSAGANS
NTTVFVSQSD	AFEGSDFSCA	DNSMINESGP	SNSTNPNSHG	FVQDSQYSGI
GSMQNEQLSD	SFPYEFFQV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Brownell E., O'Brien S.J., Nash W.G., Rice N.R. (1985). Genetic characterization of human c-rel sequences. Mol. Cell. Biol. 5: 2826—2831. PMID 3016517 doi:10.1128/MCB.5.10.2826
Li Z., Nabel G.J. (1997). A new member of the IkappaB protein family, IkappaB epsilon, inhibits RelA (p65)-mediated NF-kappaB transcription. Mol. Cell. Biol. 17: 6184—6190. PMID 9315679 doi:10.1128/MCB.17.10.6184
Martin A.G., Fresno M. (2000). Tumor necrosis factor-alpha activation of NF-kappa B requires the phosphorylation of Ser-471 in the transactivation domain of c-Rel. J. Biol. Chem. 275: 24383—24391. PMID 10823840 doi:10.1074/jbc.M909396199
Guizani-Tabbane L., Ben-Aissa K., Belghith M., Sassi A., Dellagi K. (2004). Leishmania major amastigotes induce p50/c-Rel NF-kappa B transcription factor in human macrophages: involvement in cytokine synthesis. Infect. Immun. 72: 2582—2589. PMID 15102766 doi:10.1128/IAI.72.5.2582-2589.2004
Brownell E., Mittereder N., Rice N.R. (1989). A human rel proto-oncogene cDNA containing an Alu fragment as a potential coding exon. Oncogene. 4: 935—942. PMID 2666912

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з REL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9954 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q04864 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

[1] Захворювання, генетично пов'язані з REL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9954 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q04864 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]