| KLF5
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| KLF5, BTEB2, CKLF, IKLF, Kruppel-like factor 5 (intestinal), Kruppel like factor 5 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602903 MGI: 1338056 HomoloGene: 37520 GeneCards: KLF5
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • MRF binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• regulation of microvillus assembly • microvillus assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • intestinal epithelial cell development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • Ангіогенез • skeletal muscle cell differentiation • positive regulation of fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of cell population proliferation • cellular response to peptide • cellular response to leukemia inhibitory factor • cell-cell signaling via exosome • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • регуляція експресії генів • skeletal muscle satellite cell differentiation • satellite cell activation involved in skeletal muscle regeneration • myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration • skeletal muscle tissue regeneration • positive regulation of transcription by transcription factor localization
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 13: 73.05 – 73.08 Mb
| Хр. 14: 99.54 – 99.55 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
KLF5 (англ. Kruppel like factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 50 792[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MATRVLSMSA
|
|
RLGPVPQPPA
|
|
PQDEPVFAQL
|
|
KPVLGAANPA
|
|
RDAALFPGEE
|
| LKHAHHRPQA
|
|
QPAPAQAPQP
|
|
AQPPATGPRL
|
|
PPEDLVQTRC
|
|
EMEKYLTPQL
|
| PPVPIIPEHK
|
|
KYRRDSASVV
|
|
DQFFTDTEGL
|
|
PYSINMNVFL
|
|
PDITHLRTGL
|
| YKSQRPCVTH
|
|
IKTEPVAIFS
|
|
HQSETTAPPP
|
|
APTQALPEFT
|
|
SIFSSHQTAA
|
| PEVNNIFIKQ
|
|
ELPTPDLHLS
|
|
VPTQQGHLYQ
|
|
LLNTPDLDMP
|
|
SSTNQTAAMD
|
| TLNVSMSAAM
|
|
AGLNTHTSAV
|
|
PQTAVKQFQG
|
|
MPPCTYTMPS
|
|
QFLPQQATYF
|
| PPSPPSSEPG
|
|
SPDRQAEMLQ
|
|
NLTPPPSYAA
|
|
TIASKLAIHN
|
|
PNLPTTLPVN
|
| SQNIQPVRYN
|
|
RRSNPDLEKR
|
|
RIHYCDYPGC
|
|
TKVYTKSSHL
|
|
KAHLRTHTGE
|
| KPYKCTWEGC
|
|
DWRFARSDEL
|
|
TRHYRKHTGA
|
|
KPFQCGVCNR
|
|
SFSRSDHLAL
|
| HMKRHQN
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|