| CREB3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| CREB3, LUMAN, LZIP, sLZIP, cAMP responsive element binding protein 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 606443 MGI: 99946 HomoloGene: 31375 GeneCards: CREB3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • protein dimerization activity • cAMP response element binding protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • CCR1 chemokine receptor binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cAMP response element binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • integral component of membrane • ядерні тільця • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • soma • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • гіалоплазма • Golgi membrane • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі
|
|---|
| Біологічний процес |
• negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • release from viral latency • positive regulation of cell migration • cytoplasmic sequestering of transcription factor • negative regulation of cell cycle • positive regulation of monocyte chemotaxis • transcription, DNA-templated • response to endoplasmic reticulum stress • induction of positive chemotaxis • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • хемотаксис • response to unfolded protein • regulation of cell population proliferation • regulation of cell growth • establishment of viral latency • positive regulation of deacetylase activity • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in unfolded protein response • GO:0022415 viral process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of defense response to virus by host • positive regulation of calcium ion transport • transcription by RNA polymerase II • Відповідь на незгорнуті білки • regulation of apoptotic process
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 9: 35.73 – 35.74 Mb
| Хр. 4: 43.56 – 43.57 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
CREB3 (англ. CAMP responsive element binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 43 917[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MELELDAGDQ
|
|
DLLAFLLEES
|
|
GDLGTAPDEA
|
|
VRAPLDWALP
|
|
LSEVPSDWEV
|
| DDLLCSLLSP
|
|
PASLNILSSS
|
|
NPCLVHHDHT
|
|
YSLPRETVSM
|
|
DLGECEISLT
|
| GRTGFMGLAI
|
|
HTFPFAESES
|
|
CRKEGTQMTP
|
|
QHMEELAEQE
|
|
IARLVLTDEE
|
| KSLLEKEGLI
|
|
LPETLPLTKT
|
|
EEQILKRVRR
|
|
KIRNKRSAQE
|
|
SRRKKKVYVG
|
| GLESRVLKYT
|
|
AQNMELQNKV
|
|
QLLEEQNLSL
|
|
LDQLRKLQAM
|
|
VIEISNKTSS
|
| SSTCILVLLV
|
|
SFCLLLVPAM
|
|
YSSDTRGSLP
|
|
AEHGVLSRQL
|
|
RALPSEDPYQ
|
| LELPALQSEV
|
|
PKDSTHQWLD
|
|
GSDCVLQAPG
|
|
NTSCLLHYMP
|
|
QAPSAEPPLE
|
| WPFPDLFSEP
|
|
LCRGPILPLQ
|
|
ANLTRKGGWL
|
|
PTGSPSVILQ
|
|
DRYSG
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, хемотаксис, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Lu R., Yang P., O'Hare P., Misra V. (1997). Luman, a new member of the CREB/ATF family, binds to herpes simplex virus VP16-associated host cellular factor. Mol. Cell. Biol. 17: 5117—5126. PMID 9271389 doi:10.1128/MCB.17.9.5117
- Freiman R.N., Herr W. (1997). Viral mimicry: common mode of association with HCF by VP16 and the cellular protein LZIP. Genes Dev. 11: 3122—3127. PMID 9389645 doi:10.1101/gad.11.23.3122
- Kang H., Kim Y.S., Ko J. (2009). A novel isoform of human LZIP negatively regulates the transactivation of the glucocorticoid receptor. Mol. Endocrinol. 23: 1746—1757. PMID 19779205 doi:10.1210/me.2009-0009
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Lu R., Misra V. (2000). Potential role for luman, the cellular homologue of herpes simplex virus VP16 (alpha gene trans-inducing factor), in herpesvirus latency. J. Virol. 74: 934—943. PMID 10623756 doi:10.1128/JVI.74.2.934-943.2000
- Mahajan S.S., Wilson A.C. (2000). Mutations in host cell factor 1 separate its role in cell proliferation from recruitment of VP16 and LZIP. Mol. Cell. Biol. 20: 919—928. PMID 10629049 doi:10.1128/MCB.20.3.919-928.2000
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|