ZNF593

ZNF593
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ZR9
Ідентифікатори
Символи	ZNF593, ZT86, zinc finger protein 593
Зовнішні ІД	OMIM: 616698 MGI: 1915290 HomoloGene: 41070 GeneCards: ZNF593
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв’язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • acyl binding; • acyl carrier activity; • phosphopantetheine binding; • ribosomal large subunit binding; • zinc ion binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• ядерце; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • preribosome, large subunit precursor;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • ribosomal large subunit export from nucleus; • lipid A biosynthetic process; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding; • fatty acid biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51042
	68040
	ENSG00000142684
	ENSMUSG00000028840
	O00488
	Q9DB42
	NM_015871
	NM_024215
	NP_056955
	NP_077177
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZNF593 (англ. Zinc finger protein 593) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 134 амінокислот, а молекулярна маса — 15 199^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRSRRTGAH	RAHSLARQMK	AKRRRPDLDE	IHRELRPQGS	ARPQPDPNAE
FDPDLPGGGL	HRCLACARYF	IDSTNLKTHF	RSKDHKKRLK	QLSVEPYSQE
EAERAAGMGS	YVPPRRLAVP	TEVSTEVPEM	DTST

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Terunuma A., Shiba K., Noda T. (1997). A novel genetic system to isolate a dominant negative effector on DNA-binding activity of Oct-2. Nucleic Acids Res. 25: 1984—1990. PMID 9115366 doi:10.1093/nar/25.10.1984
Hayes P.L., Lytle B.L., Volkman B.F., Peterson F.C. (2008). The solution structure of ZNF593 from Homo sapiens reveals a zinc finger in a predominantly unstructured protein. Protein Sci. 17: 571—576. PMID 18287285 doi:10.1110/ps.073290408

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30943 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00488 (англ.) . Архів оригіналу за 7 лютого 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30943 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O00488 (англ.) . Архів оригіналу за 7 лютого 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]