| POU4F2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| POU4F2, BRN3.2, BRN3B, Brn-3b, POU class 4 homeobox 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 113725 MGI: 102524 HomoloGene: 20959 GeneCards: POU4F2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • promoter-specific chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • p53 binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро • nuclear speck • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана • transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • аксоноґенеза • neuromuscular process controlling balance • слух • transcription, DNA-templated • MAPK cascade • axon guidance • retina development in camera-type eye • positive regulation of cell differentiation • Сперматогенез • neuron differentiation • axon extension • intracellular estrogen receptor signaling pathway • retinal ganglion cell axon guidance • regulation of signal transduction by p53 class mediator • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of programmed cell death • negative regulation of cell differentiation • positive regulation of osteoclast differentiation • positive regulation of axon extension • regulation of DNA-binding transcription factor activity • cellular response to cytokine stimulus • cellular response to estradiol stimulus • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • regulation of retinal ganglion cell axon guidance • negative regulation of amacrine cell differentiation • dorsal root ganglion development • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • GO:0097285 апоптоз • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • development of the heart • регуляція експресії генів • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • cellular response to insulin stimulus • positive regulation of glucose import • cellular response to oxygen levels • negative regulation of adipose tissue development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 4: 146.64 – 146.64 Mb
| н/д
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
POU4F2 (англ. POU class 4 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 409 амінокислот, а молекулярна маса — 43 087[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MMMMSLNSKQ
|
|
AFSMPHGGSL
|
|
HVEPKYSALH
|
|
STSPGSSAPI
|
|
APSASSPSSS
|
| SNAGGGGGGG
|
|
GGGGGGGGRS
|
|
SSSSSSGSSG
|
|
GGGSEAMRRA
|
|
CLPTPPSNIF
|
| GGLDESLLAR
|
|
AEALAAVDIV
|
|
SQSKSHHHHP
|
|
PHHSPFKPDA
|
|
TYHTMNTIPC
|
| TSAASSSSVP
|
|
ISHPSALAGT
|
|
HHHHHHHHHH
|
|
HHQPHQALEG
|
|
ELLEHLSPGL
|
| ALGAMAGPDG
|
|
AVVSTPAHAP
|
|
HMATMNPMHQ
|
|
AALSMAHAHG
|
|
LPSHMGCMSD
|
| VDADPRDLEA
|
|
FAERFKQRRI
|
|
KLGVTQADVG
|
|
SALANLKIPG
|
|
VGSLSQSTIC
|
| RFESLTLSHN
|
|
NMIALKPILQ
|
|
AWLEEAEKSH
|
|
REKLTKPELF
|
|
NGAEKKRKRT
|
| SIAAPEKRSL
|
|
EAYFAIQPRP
|
|
SSEKIAAIAE
|
|
KLDLKKNVVR
|
|
VWFCNQRQKQ
|
| KRMKYSAGI
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.
Література
- Ring C.J.A., Latchman D.S. (1993). The human Brn-3b POU transcription factor shows only limited homology to the Brn-3a/RDC-1 factor outside the conserved POU domain. Nucleic Acids Res. 21: 2946—2946. PMID 8332509 doi:10.1093/nar/21.12.2946
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Salichs E., Ledda A., Mularoni L., Alba M.M., de la Luna S. (2009). Genome-wide analysis of histidine repeats reveals their role in the localization of human proteins to the nuclear speckles compartment. PLoS Genet. 5: E1000397—E1000397. PMID 19266028 doi:10.1371/journal.pgen.1000397
- Bhargava A.K., Li Z., Weissman S.M. (1993). Differential expression of four members of the POU family of proteins in activated and phorbol 12-myristate 13-acetate-treated Jurkat T cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 10260—10264. PMID 8234287 doi:10.1073/pnas.90.21.10260
- Dennis J.H., Budhram-Mahadeo V., Latchman D.S. (2001). The Brn-3b POU family transcription factor regulates the cellular growth, proliferation, and anchorage dependence of MCF7 human breast cancer cells. Oncogene. 20: 4961—4971. PMID 11526481 doi:10.1038/sj.onc.1204491
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|