| BCL11A
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| BCL11A, BCL11A-L, BCL11A-S, BCL11A-XL, BCL11a-M, CTIP1, EVI9, HBFQTL5, ZNF856, B-cell CLL/lymphoma 11A, DILOS, B cell CLL/lymphoma 11A, BAF complex component, BAF chromatin remodeling complex subunit SMARCM1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 606557 MGI: 106190 HomoloGene: 11284 GeneCards: BCL11A
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Серпоподібноклітинна анемія, розлад дефіциту уваги та гіперактивності, hemoglobin E, Бета-таласемії, Dias-Logan syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• protein homodimerization activity • зв’язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein kinase binding • sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
|
|---|
| Біологічний процес |
• negative regulation of protein homooligomerization • negative regulation of neuron projection development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of dendrite development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of collateral sprouting • protein sumoylation • transcription, DNA-templated • negative regulation of collateral sprouting • positive regulation of neuron projection development • negative regulation of axon extension • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Нейрогенез • negative regulation of dendrite development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of dendrite extension • negative regulation of neuron remodeling • cellular response to L-glutamate • negative regulation of branching morphogenesis of a nerve
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 60.45 – 60.55 Mb
| Хр. 11: 24.08 – 24.17 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
BCL11A (англ. B-cell CLL/lymphoma 11A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 835 амінокислот, а молекулярна маса — 91 197[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSRRKQGKPQ
|
|
HLSKREFSPE
|
|
PLEAILTDDE
|
|
PDHGPLGAPE
|
|
GDHDLLTCGQ
|
| CQMNFPLGDI
|
|
LIFIEHKRKQ
|
|
CNGSLCLEKA
|
|
VDKPPSPSPI
|
|
EMKKASNPVE
|
| VGIQVTPEDD
|
|
DCLSTSSRGI
|
|
CPKQEHIADK
|
|
LLHWRGLSSP
|
|
RSAHGALIPT
|
| PGMSAEYAPQ
|
|
GICKDEPSSY
|
|
TCTTCKQPFT
|
|
SAWFLLQHAQ
|
|
NTHGLRIYLE
|
| SEHGSPLTPR
|
|
VGIPSGLGAE
|
|
CPSQPPLHGI
|
|
HIADNNPFNL
|
|
LRIPGSVSRE
|
| ASGLAEGRFP
|
|
PTPPLFSPPP
|
|
RHHLDPHRIE
|
|
RLGAEEMALA
|
|
THHPSAFDRV
|
| LRLNPMAMEP
|
|
PAMDFSRRLR
|
|
ELAGNTSSPP
|
|
LSPGRPSPMQ
|
|
RLLQPFQPGS
|
| KPPFLATPPL
|
|
PPLQSAPPPS
|
|
QPPVKSKSCE
|
|
FCGKTFKFQS
|
|
NLVVHRRSHT
|
| GEKPYKCNLC
|
|
DHACTQASKL
|
|
KRHMKTHMHK
|
|
SSPMTVKSDD
|
|
GLSTASSPEP
|
| GTSDLVGSAS
|
|
SALKSVVAKF
|
|
KSENDPNLIP
|
|
ENGDEEEEED
|
|
DEEEEEEEEE
|
| EEEELTESER
|
|
VDYGFGLSLE
|
|
AARHHENSSR
|
|
GAVVGVGDES
|
|
RALPDVMQGM
|
| VLSSMQHFSE
|
|
AFHQVLGEKH
|
|
KRGHLAEAEG
|
|
HRDTCDEDSV
|
|
AGESDRIDDG
|
| TVNGRGCSPG
|
|
ESASGGLSKK
|
|
LLLGSPSSLS
|
|
PFSKRIKLEK
|
|
EFDLPPAAMP
|
| NTENVYSQWL
|
|
AGYAASRQLK
|
|
DPFLSFGDSR
|
|
QSPFASSSEH
|
|
SSENGSLRFS
|
| TPPGELDGGI
|
|
SGRSGTGSGG
|
|
STPHISGPGP
|
|
GRPSSKEGRR
|
|
SDTCEYCGKV
|
| FKNCSNLTVH
|
|
RRSHTGERPY
|
|
KCELCNYACA
|
|
QSSKLTRHMK
|
|
THGQVGKDVY
|
| KCEICKMPFS
|
|
VYSTLEKHMK
|
|
KWHSDRVLNN
|
|
DIKTE
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Saiki Y., Yamazaki Y., Yoshida M., Katoh O., Nakamura T. (2000). Human EVI9, a homologue of the mouse myeloid leukemia gene, is expressed in the hematopoietic progenitors and down-regulated during myeloid differentiation of HL60 cells. Genomics. 70: 387—391. PMID 11161790 doi:10.1006/geno.2000.6385
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 doi:10.1093/dnares/8.2.85
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Bauer D.E., Orkin S.H. (2015). Hemoglobin switching's surprise: the versatile transcription factor BCL11A is a master repressor of fetal hemoglobin. Curr. Opin. Genet. Dev. 33: 62—70. PMID 26375765 doi:10.1016/j.gde.2015.08.001
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|