IRF1

IRF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IF1
Ідентифікатори
Символи	IRF1, IRF-1, MAR, interferon regulatory factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 147575 MGI: 96590 HomoloGene: 1658 GeneCards: IRF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0097285 апоптоз; • regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell proliferation; • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; • regulation of innate immune response; • negative regulation of regulatory T cell differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to interferon-beta; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • процес імунної системи; • regulation of adaptive immune response; • зсідання крові; • regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • regulation of cell cycle; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • cellular response to mechanical stimulus; • defense response to virus; • type I interferon signaling pathway; • regulation of immune response; • регуляція експресії генів; • вроджений імунітет; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of type I interferon production; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of interferon-beta production;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3659
	16362
	ENSG00000125347
	ENSMUSG00000018899
	P10914
	P15314
	NM_002198
	NM_001159393; NM_001159396; NM_008390
	NP_002189; NP_001341853; NP_001341854
	NP_001152865; NP_001152868; NP_032416
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IRF1 (англ. Interferon regulatory factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 36 502^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPITRMRMRP	WLEMQINSNQ	IPGLIWINKE	EMIFQIPWKH	AAKHGWDINK
DACLFRSWAI	HTGRYKAGEK	EPDPKTWKAN	FRCAMNSLPD	IEEVKDQSRN
KGSSAVRVYR	MLPPLTKNQR	KERKSKSSRD	AKSKAKRKSC	GDSSPDTFSD
GLSSSTLPDD	HSSYTVPGYM	QDLEVEQALT	PALSPCAVSS	TLPDWHIPVE
VVPDSTSDLY	NFQVSPMPST	SEATTDEDEE	GKLPEDIMKL	LEQSEWQPTN
VDGKGYLLNE	PGVQPTSVYG	DFSCKEEPEI	DSPGGDIGLS	LQRVFTDLKN
MDATWLDSLL	TPVRLPSIQA	IPCAP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, антивірусний захист, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Maruyama M., Fujita T., Taniguchi T. (1989). Sequence of a cDNA coding for human IRF-1. Nucleic Acids Res. 17: 3292—3292. PMID 2726461 doi:10.1093/nar/17.8.3292
Cha Y., Sims S.H., Romine M.F., Kaufmann M., Deisseroth A.B. (1992). Human interferon regulatory factor 1: intron-exon organization. DNA Cell Biol. 11: 605—611. PMID 1382447 doi:10.1089/dna.1992.11.605
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Lin R., Hiscott J. (1999). A role for casein kinase II phosphorylation in the regulation of IRF-1 transcriptional activity. Mol. Cell. Biochem. 191: 169—180. PMID 10094406 doi:10.1023/A:1006850009017
Taniguchi T., Ogasawara K., Takaoka A., Tanaka N. (2001). IRF family of transcription factors as regulators of host defense. Annu. Rev. Immunol. 19: 623—655. PMID 11244049 doi:10.1146/annurev.immunol.19.1.623
Kroeger A., Koester M., Schroeder K., Hauser H., Mueller P.P. (2002). Activities of IRF-1. J. Interferon Cytokine Res. 22: 5—14. PMID 11846971 doi:10.1089/107999002753452610

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6116 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P10914 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6116 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P10914 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]