| PHOX2A
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| PHOX2A, ARIX, CFEOM2, FEOM2, NCAM2, PMX2A, paired like homeobox 2a |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602753 MGI: 106633 HomoloGene: 31296 GeneCards: PHOX2A
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• somatic motor neuron differentiation • parasympathetic nervous system development • regulation of respiratory gaseous exchange • dopaminergic neuron differentiation • noradrenergic neuron differentiation • locus ceruleus development • trochlear nerve formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • sympathetic nervous system development • oculomotor nerve formation • transcription, DNA-templated • midbrain development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • autonomic nervous system development • enteric nervous system development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 11: 72.24 – 72.25 Mb
| Хр. 7: 101.47 – 101.47 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
PHOX2A (англ. Paired like homeobox 2a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 29 653[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDYSYLNSYD
|
|
SCVAAMEASA
|
|
YGDFGACSQP
|
|
GGFQYSPLRP
|
|
AFPAAGPPCP
|
| ALGSSNCALG
|
|
ALRDHQPAPY
|
|
SAVPYKFFPE
|
|
PSGLHEKRKQ
|
|
RRIRTTFTSA
|
| QLKELERVFA
|
|
ETHYPDIYTR
|
|
EELALKIDLT
|
|
EARVQVWFQN
|
|
RRAKFRKQER
|
| AASAKGAAGA
|
|
AGAKKGEARC
|
|
SSEDDDSKES
|
|
TCSPTPDSTA
|
|
SLPPPPAPGL
|
| ASPRLSPSPL
|
|
PVALGSGPGP
|
|
GPGPQPLKGA
|
|
LWAGVAGGGG
|
|
GGPGAGAAEL
|
| LKAWQPAESG
|
|
PGPFSGVLSS
|
|
FHRKPGPALK
|
|
TNLF
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|