| FOXK2
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXK2, ILF, ILF-1, ILF1, forkhead box K2, nGTBP |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 147685 MGI: 1916087 HomoloGene: 18748 GeneCards: FOXK2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • magnesium ion binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular glucose homeostasis • negative regulation of autophagy • regulation of glucose metabolic process • response to starvation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • canonical glycolysis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 82.52 – 82.64 Mb
| Хр. 11: 121.26 – 121.31 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXK2 (англ. Forkhead box K2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 69 062[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAAAAAALSG
|
|
AGTPPAGGGA
|
|
GGGGAGGGGS
|
|
PPGGWAVARL
|
|
EGREFEYLMK
|
| KRSVTIGRNS
|
|
SQGSVDVSMG
|
|
HSSFISRRHL
|
|
EIFTPPGGGG
|
|
HGGAAPELPP
|
| AQPRPDAGGD
|
|
FYLRCLGKNG
|
|
VFVDGVFQRR
|
|
GAPPLQLPRV
|
|
CTFRFPSTNI
|
| KITFTALSSE
|
|
KREKQEASES
|
|
PVKAVQPHIS
|
|
PLTINIPDTM
|
|
AHLISPLPSP
|
| TGTISAANSC
|
|
PSSPRGAGSS
|
|
GYKVGRVMPS
|
|
DLNLMADNSQ
|
|
PENEKEASGG
|
| DSPKDDSKPP
|
|
YSYAQLIVQA
|
|
ITMAPDKQLT
|
|
LNGIYTHITK
|
|
NYPYYRTADK
|
| GWQNSIRHNL
|
|
SLNRYFIKVP
|
|
RSQEEPGKGS
|
|
FWRIDPASES
|
|
KLIEQAFRKR
|
| RPRGVPCFRT
|
|
PLGPLSSRSA
|
|
PASPNHAGVL
|
|
SAHSSGAQTP
|
|
ESLSREGSPA
|
| PLEPEPGAAQ
|
|
PKLAVIQEAR
|
|
FAQSAPGSPL
|
|
SSQPVLITVQ
|
|
RQLPQAIKPV
|
| TYTVATPVTT
|
|
STSQPPVVQT
|
|
VHVVHQIPAV
|
|
SVTSVAGLAP
|
|
ANTYTVSGQA
|
| VVTPAAVLAP
|
|
PKAEAQENGD
|
|
HREVKVKVEP
|
|
IPAIGHATLG
|
|
TASRIIQTAQ
|
| TTPVQTVTIV
|
|
QQAPLGQHQL
|
|
PIKTVTQNGT
|
|
HVASVPTAVH
|
|
GQVNNAAASP
|
| LHMLATHASA
|
|
SASLPTKRHN
|
|
GDQPEQPELK
|
|
RIKTEDGEGI
|
|
VIALSVDTPP
|
| AAVREKGVQN
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію.
Локалізований у ядрі.
Література
- Li C., Lai C., Sigman D.S., Gaynor R.B. (1991). Cloning of a cellular factor, interleukin binding factor, that binds to NFAT-like motifs in the human immunodeficiency virus long terminal repeat. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7739—7743. PMID 1909027 doi:10.1073/pnas.88.17.7739
- Li C., Lusis A.J., Sparkes R., Nirula A., Gaynor R.B. (1992). Characterization and chromosomal mapping of the gene encoding the cellular DNA binding protein ILF. Genomics. 13: 665—671. PMID 1339390 doi:10.1016/0888-7543(92)90139-J
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|