| FOXJ1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXJ1, FKHL13, HFH-4, HFH4, forkhead box J1, CILD43 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602291 MGI: 1347474 HomoloGene: 1117 GeneCards: FOXJ1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• determination of left/right symmetry • positive regulation of lung ciliated cell differentiation • cell projection organization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • metanephric part of ureteric bud development • pattern specification process • transcription, DNA-templated • glomerular parietal epithelial cell development • regulation of epithelial cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of T cell proliferation • left/right pattern formation • Сперматогенез • development of the heart • negative regulation of T cell differentiation in thymus • cilium assembly • establishment of apical/basal cell polarity • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • negative regulation of B cell activation • positive regulation of central B cell tolerance induction • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • epithelium development • negative regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin • brain development • humoral immune response • negative regulation of germinal center formation • осередкова індукція толерантності • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • lung epithelium development • actin cytoskeleton organization • leukocyte migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • motile cilium assembly • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 76.14 – 76.14 Mb
| Хр. 11: 116.22 – 116.23 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXJ1 (англ. Forkhead box J1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 421 амінокислот, а молекулярна маса — 45 247[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAESWLRLSG
|
|
AGPAEEAGPE
|
|
GGLEEPDALD
|
|
DSLTSLQWLQ
|
|
EFSILNAKAP
|
| ALPPGGTDPH
|
|
GYHQVPGSAA
|
|
PGSPLAADPA
|
|
CLGQPHTPGK
|
|
PTSSCTSRSA
|
| PPGLQAPPPD
|
|
DVDYATNPHV
|
|
KPPYSYATLI
|
|
CMAMQASKAT
|
|
KITLSAIYKW
|
| ITDNFCYFRH
|
|
ADPTWQNSIR
|
|
HNLSLNKCFI
|
|
KVPREKDEPG
|
|
KGGFWRIDPQ
|
| YAERLLSGAF
|
|
KKRRLPPVHI
|
|
HPAFARQAAQ
|
|
EPSAVPRAGP
|
|
LTVNTEAQQL
|
| LREFEEATGE
|
|
AGWGAGEGRL
|
|
GHKRKQPLPK
|
|
RVAKVPRPPS
|
|
TLLPTPEEQG
|
| ELEPLKGNFD
|
|
WEAIFDAGTL
|
|
GGELGALEAL
|
|
ELSPPLSPAS
|
|
HVDVDLTIHG
|
| RHIDCPATWG
|
|
PSVEQAADSL
|
|
DFDETFLATS
|
|
FLQHPWDESG
|
|
SGCLPPEPLF
|
| EAGDATLASD
|
|
LQDWASVGAF
|
|
L
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біогенез та деградація війок.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Li C.-S., Chae S.-C., Lee J.-H., Zhang Q., Chung H.-T. (2006). Identification of single nucleotide polymorphisms in FOXJ1 and their association with allergic rhinitis. J. Hum. Genet. 51: 292—297. PMID 16518568 doi:10.1007/s10038-006-0359-8
- Pelletier G.J., Brody S.L., Liapis H., White R.A., Hackett B.P. (1998). A human forkhead/winged-helix transcription factor expressed in developing pulmonary and renal epithelium. Am. J. Physiol. 274: L351—L359. PMID 9530170
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|