| GATA1
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| GATA1, ERYF1, GATA-1, GF-1, GF1, NF-E1, NFE1, XLANP, XLTDA, XLTT, GATA binding protein 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 305371 MGI: 95661 HomoloGene: 1549 GeneCards: GATA1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| X-linked dyserythropoetic anemia with abnormal platelets and neutropenia, Diamond-Blackfan anemia[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• C2H2 zinc finger domain binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • DNA binding • p53 binding • DNA binding, bending • chromatin DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • zinc ion binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription repressor complex • transcription regulator complex • protein-DNA complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • eosinophil fate commitment • in utero embryonic development • regulation of glycoprotein biosynthetic process • cellular response to thyroid hormone stimulus • зсідання крові • erythrocyte differentiation • Тромбоцитопоез • positive regulation of osteoblast proliferation • transcription by RNA polymerase II • platelet aggregation • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of primitive erythrocyte differentiation • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • regulation of definitive erythrocyte differentiation • cell-cell signaling • embryonic hemopoiesis • розвиток клітин • positive regulation of erythrocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • megakaryocyte differentiation • dendritic cell differentiation • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of bone mineralization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • male gonad development • myeloid cell differentiation • negative regulation of apoptotic process • homeostasis of number of cells within a tissue • transcription, DNA-templated • basophil differentiation • eosinophil differentiation • erythrocyte development • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • development of the heart • animal organ morphogenesis • гістогенез • anatomical structure formation involved in morphogenesis • digestive tract development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. X: 48.79 – 48.79 Mb
| Хр. X: 7.83 – 7.84 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
GATA1 (англ. GATA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 413 амінокислот, а молекулярна маса — 42 751[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MEFPGLGSLG
|
|
TSEPLPQFVD
|
|
PALVSSTPES
|
|
GVFFPSGPEG
|
|
LDAAASSTAP
|
| STATAAAAAL
|
|
AYYRDAEAYR
|
|
HSPVFQVYPL
|
|
LNCMEGIPGG
|
|
SPYAGWAYGK
|
| TGLYPASTVC
|
|
PTREDSPPQA
|
|
VEDLDGKGST
|
|
SFLETLKTER
|
|
LSPDLLTLGP
|
| ALPSSLPVPN
|
|
SAYGGPDFSS
|
|
TFFSPTGSPL
|
|
NSAAYSSPKL
|
|
RGTLPLPPCE
|
| ARECVNCGAT
|
|
ATPLWRRDRT
|
|
GHYLCNACGL
|
|
YHKMNGQNRP
|
|
LIRPKKRLIV
|
| SKRAGTQCTN
|
|
CQTTTTTLWR
|
|
RNASGDPVCN
|
|
ACGLYYKLHQ
|
|
VNRPLTMRKD
|
| GIQTRNRKAS
|
|
GKGKKKRGSS
|
|
LGGTGAAEGP
|
|
AGGFMVVAGG
|
|
SGSGNCGEVA
|
| SGLTLGPPGT
|
|
AHLYQGLGPV
|
|
VLSGPVSHLM
|
|
PFPGPLLGSP
|
|
TGSFPTGPMP
|
| PTTSTTVVAP
|
|
LSS
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Trainor C.D., Evans T., Felsenfeld G., Boguski M.S. (1990). Structure and evolution of a human erythroid transcription factor. Nature. 343: 92—96. PMID 2104960 doi:10.1038/343092a0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Calligaris R., Bottardi S., Cogoi S., Apezteguia I., Santoro C. (1995). Alternative translation initiation site usage results in two functionally distinct forms of the GATA-1 transcription factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11598—11602. PMID 8524811 doi:10.1073/pnas.92.25.11598
- Boyes J., Byfield P., Nakatani Y., Ogryzko V. (1998). Regulation of activity of the transcription factor GATA-1 by acetylation. Nature. 396: 594—598. PMID 9859997 doi:10.1038/25166
- Kuo Y.-Y., Chang Z.-F. (2007). GATA-1 and Gfi-1B interplay to regulate Bcl-xL transcription. Mol. Cell. Biol. 27: 4261—4272. PMID 17420275 doi:10.1128/MCB.02212-06
- Mehaffey M.G., Newton A.L., Gandhi M.J., Crossley M., Drachman J.G. (2001). X-linked thrombocytopenia caused by a novel mutation of GATA-1. Blood. 98: 2681—2688. PMID 11675338 doi:10.1182/blood.V98.9.2681
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|