| KLF17
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| KLF17, ZNF393, Zfp393, Kruppel-like factor 17, Kruppel like factor 17, ZLF393 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 609602 MGI: 2181068 HomoloGene: 12621 GeneCards: KLF17
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 44.12 – 44.14 Mb
| Хр. 4: 117.62 – 117.62 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
KLF17 (англ. Kruppel like factor 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 42 577[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MYGRPQAEME
|
|
QEAGELSRWQ
|
|
AAHQAAQDNE
|
|
NSAPILNMSS
|
|
SSGSSGVHTS
|
| WNQGLPSIQH
|
|
FPHSAEMLGS
|
|
PLVSVEAPGQ
|
|
NVNEGGPQFS
|
|
MPLPERGMSY
|
| CPQATLTPSR
|
|
MIYCQRMSPP
|
|
QQEMTIFSGP
|
|
QLMPVGEPNI
|
|
PRVARPFGGN
|
| LRMPPNGLPV
|
|
SASTGIPIMS
|
|
HTGNPPVPYP
|
|
GLSTVPSDET
|
|
LLGPTVPSTE
|
| AQAVLPSMAQ
|
|
MLPPQDAHDL
|
|
GMPPAESQSL
|
|
LVLGSQDSLV
|
|
SQPDSQEGPF
|
| LPEQPGPAPQ
|
|
TVEKNSRPQE
|
|
GTGRRGSSEA
|
|
RPYCCNYENC
|
|
GKAYTKRSHL
|
| VSHQRKHTGE
|
|
RPYSCNWESC
|
|
SWSFFRSDEL
|
|
RRHMRVHTRY
|
|
RPYKCDQCSR
|
| EFMRSDHLKQ
|
|
HQKTHRPGPS
|
|
DPQANNNNGE
|
|
QDSPPAAGP
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|