| SOX10
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SOX10, DOM, PCWH, WS2E, WS4, WS4C, SRY-box 10, SRY-box transcription factor 10, SOX-10 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602229 MGI: 98358 HomoloGene: 5055 GeneCards: SOX10
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Waardenburg syndrome type 2E, Waardenburg syndrome type 4C, PCWH syndrome, Waardenburg-Shah syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • promoter-specific chromatin binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • хроматин • мітохондрія • мітохондріальна зовнішня мембрана • мембрана • extrinsic component of mitochondrial outer membrane
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • negative regulation of Schwann cell proliferation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of myelination • cellular response to progesterone stimulus • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • oligodendrocyte development • central nervous system myelination • oligodendrocyte differentiation • in utero embryonic development • neural crest cell migration • morphogenesis of an epithelium • positive regulation of neuroblast proliferation • central nervous system development • peripheral nervous system development • positive regulation of gliogenesis • диференціація клітин • melanocyte differentiation • lacrimal gland development • negative regulation of apoptotic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cell maturation • enteric nervous system development • digestive tract morphogenesis • developmental growth • morphogenesis of a branching epithelium • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 22: 37.97 – 37.99 Mb
| Хр. 15: 79.04 – 79.05 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
SOX10 (англ. SRY-box 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 49 911[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAEEQDLSEV
|
|
ELSPVGSEEP
|
|
RCLSPGSAPS
|
|
LGPDGGGGGS
|
|
GLRASPGPGE
|
| LGKVKKEQQD
|
|
GEADDDKFPV
|
|
CIREAVSQVL
|
|
SGYDWTLVPM
|
|
PVRVNGASKS
|
| KPHVKRPMNA
|
|
FMVWAQAARR
|
|
KLADQYPHLH
|
|
NAELSKTLGK
|
|
LWRLLNESDK
|
| RPFIEEAERL
|
|
RMQHKKDHPD
|
|
YKYQPRRRKN
|
|
GKAAQGEAEC
|
|
PGGEAEQGGT
|
| AAIQAHYKSA
|
|
HLDHRHPGEG
|
|
SPMSDGNPEH
|
|
PSGQSHGPPT
|
|
PPTTPKTELQ
|
| SGKADPKRDG
|
|
RSMGEGGKPH
|
|
IDFGNVDIGE
|
|
ISHEVMSNME
|
|
TFDVAELDQY
|
| LPPNGHPGHV
|
|
SSYSAAGYGL
|
|
GSALAVASGH
|
|
SAWISKPPGV
|
|
ALPTVSPPGV
|
| DAKAQVKTET
|
|
AGPQGPPHYT
|
|
DQPSTSQIAY
|
|
TSLSLPHYGS
|
|
AFPSISRPQF
|
| DYSDHQPSGP
|
|
YYGHSGQASG
|
|
LYSAFSYMGP
|
|
SQRPLYTAIS
|
|
DPSPSGPQSH
|
| SPTHWEQPVY
|
|
TTLSRP
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|