| TBPL2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TBPL2, TBP2, TRF3, TATA-box binding protein like 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 608964 MGI: 2684058 HomoloGene: 133152 GeneCards: TBPL2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро • transcription factor TFIIIB complex • transcription regulator complex • transcription factor TFIID complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• multicellular organism development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase III preinitiation complex assembly
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 55.41 – 55.46 Mb
| Хр. 2: 23.96 – 23.99 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
TBPL2 (англ. TATA-box binding protein like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 375 амінокислот, а молекулярна маса — 41 524[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MASAPWPERV
|
|
PRLLAPRLPS
|
|
YPPPPPTVGL
|
|
RSMEQEETYL
|
|
ELYLDQCAAQ
|
| DGLAPPRSPL
|
|
FSPVVPYDMY
|
|
ILNASNPDTA
|
|
FNSNPEVKET
|
|
SGDFSSVDLS
|
| FLPDEVTQEN
|
|
KDQPVISKHE
|
|
TEENSESQSP
|
|
QSRLPSPSEQ
|
|
DVGLGLNSSS
|
| LSNSHSQLHP
|
|
GDTDSVQPSP
|
|
EKPNSDSLSL
|
|
ASITPMTPMT
|
|
PISECCGIVP
|
| QLQNIVSTVN
|
|
LACKLDLKKI
|
|
ALHAKNAEYN
|
|
PKRFAAVIMR
|
|
IREPRTTALI
|
| FSSGKMVCTG
|
|
AKSEEQSRLA
|
|
ARKYARVVQK
|
|
LGFPARFLDF
|
|
KIQNMVGSCD
|
| VRFPIRLEGL
|
|
VLTHQQFSSY
|
|
EPELFPGLIY
|
|
RMVKPRIVLL
|
|
IFVSGKVVLT
|
| GAKERSEIYE
|
|
AFENIYPILK
|
|
GFKKA
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|