| EGR3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| EGR3, EGR-3, PILOT, early growth response 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602419 MGI: 1306780 HomoloGene: 37923 GeneCards: EGR3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв’язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• циркадний ритм • endothelial cell chemotaxis • cell migration involved in sprouting angiogenesis • muscle organ development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of endothelial cell proliferation • cellular response to fibroblast growth factor stimulus • negative regulation of apoptotic process • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus • transcription, DNA-templated • neuromuscular synaptic transmission • peripheral nervous system development • positive regulation of T cell differentiation in thymus • regulation of gamma-delta T cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to growth factor stimulus
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 8: 22.69 – 22.69 Mb
| Хр. 14: 70.31 – 70.32 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
EGR3 (англ. Early growth response 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 387 амінокислот, а молекулярна маса — 42 613[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MTGKLAEKLP
|
|
VTMSSLLNQL
|
|
PDNLYPEEIP
|
|
SALNLFSGSS
|
|
DSVVHYNQMA
|
| TENVMDIGLT
|
|
NEKPNPELSY
|
|
SGSFQPAPGN
|
|
KTVTYLGKFA
|
|
FDSPSNWCQD
|
| NIISLMSAGI
|
|
LGVPPASGAL
|
|
STQTSTASMV
|
|
QPPQGDVEAM
|
|
YPALPPYSNC
|
| GDLYSEPVSF
|
|
HDPQGNPGLA
|
|
YSPQDYQSAK
|
|
PALDSNLFPM
|
|
IPDYNLYHHP
|
| NDMGSIPEHK
|
|
PFQGMDPIRV
|
|
NPPPITPLET
|
|
IKAFKDKQIH
|
|
PGFGSLPQPP
|
| LTLKPIRPRK
|
|
YPNRPSKTPL
|
|
HERPHACPAE
|
|
GCDRRFSRSD
|
|
ELTRHLRIHT
|
| GHKPFQCRIC
|
|
MRSFSRSDHL
|
|
TTHIRTHTGE
|
|
KPFACEFCGR
|
|
KFARSDERKR
|
| HAKIHLKQKE
|
|
KKAEKGGAPS
|
|
ASSAPPVSLA
|
|
PVVTTCA
|
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Mages H.W., Stamminger T., Rilke O., Bravo R., Kroczek R.A. (1993). Expression of PILOT, a putative transcription factor, requires two signals and is cyclosporin A sensitive in T cells. Int. Immunol. 5: 63—70. PMID 8443122 doi:10.1093/intimm/5.1.63
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|