| HOXA5
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXA5, HOX1, HOX1.3, HOX1C, homeobox A5 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142952 MGI: 96177 HomoloGene: 40726 GeneCards: HOXA5
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • pattern specification process • skeletal system development • respiratory system process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism growth • lung development • trachea morphogenesis • bronchiole development • cell-cell signaling involved in mammary gland development • regulation of mammary gland epithelial cell proliferation • mammary gland alveolus development • lung goblet cell differentiation • transcription, DNA-templated • mammary gland epithelial cell differentiation • negative regulation of erythrocyte differentiation • respiratory gaseous exchange by respiratory system • trachea cartilage morphogenesis • embryonic skeletal system development • morphogenesis of an epithelium • multicellular organism development • thyroid gland development • lobar bronchus epithelium development • mesenchymal-epithelial cell signaling • positive regulation of apoptotic process • intestinal epithelial cell maturation • negative regulation of angiogenesis • cartilage morphogenesis • lung alveolus development • lung-associated mesenchyme development • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • cell migration • positive regulation of myeloid cell differentiation • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 7: 27.14 – 27.14 Mb
| Хр. 6: 52.18 – 52.18 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXA5 (англ. Homeobox A5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 29 345[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSSYFVNSFC
|
|
GRYPNGPDYQ
|
|
LHNYGDHSSV
|
|
SEQFRDSASM
|
|
HSGRYGYGYN
|
| GMDLSVGRSG
|
|
SGHFGSGERA
|
|
RSYAASASAA
|
|
PAEPRYSQPA
|
|
TSTHSPQPDP
|
| LPCSAVAPSP
|
|
GSDSHHGGKN
|
|
SLSNSSGASA
|
|
DAGSTHISSR
|
|
EGVGTASGAE
|
| EDAPASSEQA
|
|
SAQSEPSPAP
|
|
PAQPQIYPWM
|
|
RKLHISHDNI
|
|
GGPEGKRART
|
| AYTRYQTLEL
|
|
EKEFHFNRYL
|
|
TRRRRIEIAH
|
|
ALCLSERQIK
|
|
IWFQNRRMKW
|
| KKDNKLKSMS
|
|
MAAAGGAFRP
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|