| RUNX3
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| RUNX3, AML2, CBFA3, PEBP2aC, runt related transcription factor 3, RUNX family transcription factor 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600210 MGI: 102672 HomoloGene: 37914 GeneCards: RUNX3
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Хвороба Крона[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро • ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • гіалоплазма • core-binding factor complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• peripheral nervous system neuron development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chondrocyte differentiation • осифікація • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell cycle • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • protein phosphorylation • negative regulation of epithelial cell proliferation • регуляція диференціювання клітин • response to transforming growth factor beta • кровотворення • negative regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation • neuron differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 24.9 – 24.97 Mb
| Хр. 4: 134.85 – 134.91 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
RUNX3 (англ. Runt related transcription factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 415 амінокислот, а молекулярна маса — 44 356[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MRIPVDPSTS
|
|
RRFTPPSPAF
|
|
PCGGGGGKMG
|
|
ENSGALSAQA
|
|
AVGPGGRARP
|
| EVRSMVDVLA
|
|
DHAGELVRTD
|
|
SPNFLCSVLP
|
|
SHWRCNKTLP
|
|
VAFKVVALGD
|
| VPDGTVVTVM
|
|
AGNDENYSAE
|
|
LRNASAVMKN
|
|
QVARFNDLRF
|
|
VGRSGRGKSF
|
| TLTITVFTNP
|
|
TQVATYHRAI
|
|
KVTVDGPREP
|
|
RRHRQKLEDQ
|
|
TKPFPDRFGD
|
| LERLRMRVTP
|
|
STPSPRGSLS
|
|
TTSHFSSQPQ
|
|
TPIQGTSELN
|
|
PFSDPRQFDR
|
| SFPTLPTLTE
|
|
SRFPDPRMHY
|
|
PGAMSAAFPY
|
|
SATPSGTSIS
|
|
SLSVAGMPAT
|
| SRFHHTYLPP
|
|
PYPGAPQNQS
|
|
GPFQANPSPY
|
|
HLYYGTSSGS
|
|
YQFSMVAGSS
|
| SGGDRSPTRM
|
|
LASCTSSAAS
|
|
VAAGNLMNPS
|
|
LGGQSDGVEA
|
|
DGSHSNSPTA
|
| LSTPGRMDEA
|
|
VWRPY
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|