| SOX15
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SOX15, SOX20, SOX26, SOX27, SRY-box 15, SRY-box transcription factor 15 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601297 MGI: 98363 HomoloGene: 74586 GeneCards: SOX15
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of myoblast proliferation • диференціація клітин • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of satellite cell activation involved in skeletal muscle regeneration • negative regulation of striated muscle tissue development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of G0 to G1 transition • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • myoblast development • skeletal muscle tissue regeneration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • central nervous system development • neuron differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 7.59 – 7.59 Mb
| Хр. 11: 69.55 – 69.55 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
SOX15 (англ. SRY-box 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 233 амінокислот, а молекулярна маса — 25 251[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MALPGSSQDQ
|
|
AWSLEPPAAT
|
|
AAASSSSGPQ
|
|
EREGAGSPAA
|
|
PGTLPLEKVK
|
| RPMNAFMVWS
|
|
SAQRRQMAQQ
|
|
NPKMHNSEIS
|
|
KRLGAQWKLL
|
|
DEDEKRPFVE
|
| EAKRLRARHL
|
|
RDYPDYKYRP
|
|
RRKAKSSGAG
|
|
PSRCGQGRGN
|
|
LASGGPLWGP
|
| GYATTQPSRG
|
|
FGYRPPSYST
|
|
AYLPGSYGSS
|
|
HCKLEAPSPC
|
|
SLPQSDPRLQ
|
| GELLPTYTHY
|
|
LPPGSPTPYN
|
|
PPLAGAPMPL
|
|
THL
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Goze C., Poulat F., Berta P. (1993). Partial cloning of SOX-11 and SOX-12, two new human SOX genes. Nucleic Acids Res. 21: 2943—2943. PMID 8332506 doi:10.1093/nar/21.12.2943
- Vujic M., Rajic T., Goodfellow P.N., Stevanovic M. (1998). cDNA characterization and high resolution mapping of the human SOX20 gene. Mamm. Genome. 9: 1059—1061. PMID 9880678 doi:10.1007/s003359900925
- Meyer J., Wirth J., Held M., Schempp W., Scherer G. (1996). SOX20, a new member of the SOX gene family, is located on chromosome 17p13. Cytogenet. Cell Genet. 72: 246—249. PMID 8978787
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|