SREBF1

SREBF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AM9
Ідентифікатори
Символи	SREBF1, SREBP-1c, SREBP1, bHLHd1, SREBP1a, sterol regulatory element binding transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 184756 MGI: 107606 HomoloGene: 3079 GeneCards: SREBF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sterol response element binding; • chromatin binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein kinase binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • GO:0010577 enzyme activator activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • nuclear envelope; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • Golgi membrane; • нуклеоплазма; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • клітинне ядро; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• positive regulation of histone deacetylation; • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway; • positive regulation of triglyceride biosynthetic process; • steroid metabolic process; • negative regulation of insulin secretion; • response to fatty acid; • lipid biosynthetic process; • response to glucagon; • regulation of protein stability; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • response to retinoic acid; • GO:1904578 response to organic cyclic compound; • lung development; • Обмін жирів; • regulation of insulin secretion; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to starvation; • response to progesterone; • GO:0010260 старіння людини; • response to peptide hormone; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • cholesterol metabolic process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to glucose; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • response to lipid; • cellular response to fatty acid; • regulation of autophagy of mitochondrion; • regulation of protein targeting to mitochondrion; • regulation of fatty acid metabolic process; • циркадний ритм; • cellular response to insulin stimulus; • response to food; • positive regulation of cholesterol biosynthetic process; • response to cAMP; • regulation of heart rate by chemical signal; • fat cell differentiation; • intracellular receptor signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of cholesterol biosynthetic process; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6720
	20787
	ENSG00000072310
	ENSMUSG00000020538
	P36956
	Q9WTN3
	NM_001005291; NM_004176; NM_001321096
	NM_011480; NM_001313979; NM_001358314; NM_001358315
	NP_001005291; NP_001308025; NP_004167
	NP_001300908; NP_035610; NP_001345243; NP_001345244
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SREBF1 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 147 амінокислот, а молекулярна маса — 121 675^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEPPFSEAA	LEQALGEPCD	LDAALLTDIE	DMLQLINNQD	SDFPGLFDPP
YAGSGAGGTD	PASPDTSSPG	SLSPPPATLS	SSLEAFLSGP	QAAPSPLSPP
QPAPTPLKMY	PSMPAFSPGP	GIKEESVPLS	ILQTPTPQPL	PGALLPQSFP
APAPPQFSST	PVLGYPSPPG	GFSTGSPPGN	TQQPLPGLPL	ASPPGVPPVS
LHTQVQSVVP	QQLLTVTAAP	TAAPVTTTVT	SQIQQVPVLL	QPHFIKADSL
LLTAMKTDGA	TVKAAGLSPL	VSGTTVQTGP	LPTLVSGGTI	LATVPLVVDA
EKLPINRLAA	GSKAPASAQS	RGEKRTAHNA	IEKRYRSSIN	DKIIELKDLV
VGTEAKLNKS	AVLRKAIDYI	RFLQHSNQKL	KQENLSLRTA	VHKSKSLKDL
VSACGSGGNT	DVLMEGVKTE	VEDTLTPPPS	DAGSPFQSSP	LSLGSRGSGS
GGSGSDSEPD	SPVFEDSKAK	PEQRPSLHSR	GMLDRSRLAL	CTLVFLCLSC
NPLASLLGAR	GLPSPSDTTS	VYHSPGRNVL	GTESRDGPGW	AQWLLPPVVW
LLNGLLVLVS	LVLLFVYGEP	VTRPHSGPAV	YFWRHRKQAD	LDLARGDFAQ
AAQQLWLALR	ALGRPLPTSH	LDLACSLLWN	LIRHLLQRLW	VGRWLAGRAG
GLQQDCALRV	DASASARDAA	LVYHKLHQLH	TMGKHTGGHL	TATNLALSAL
NLAECAGDAV	SVATLAEIYV	AAALRVKTSL	PRALHFLTRF	FLSSARQACL
AQSGSVPPAM	QWLCHPVGHR	FFVDGDWSVL	STPWESLYSL	AGNPVDPLAQ
VTQLFREHLL	ERALNCVTQP	NPSPGSADGD	KEFSDALGYL	QLLNSCSDAA
GAPAYSFSIS	SSMATTTGVD	PVAKWWASLT	AVVIHWLRRD	EEAAERLCPL
VEHLPRVLQE	SERPLPRAAL	HSFKAARALL	GCAKAESGPA	SLTICEKASG
YLQDSLATTP	ASSSIDKAVQ	LFLCDLLLVV	RTSLWRQQQP	PAPAPAAQGT
SSRPQASALE	LRGFQRDLSS	LRRLAQSFRP	AMRRVFLHEA	TARLMAGASP
TRTHQLLDRS	LRRRAGPGGK	GGAVAELEPR	PTRREHAEAL	LLASCYLPPG
FLSAPGQRVG	MLAEAARTLE	KLGDRRLLHD	CQQMLMRLGG	GTTVTSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

Hua X., Wu J., Goldstein J.L., Brown M.S., Hobbs H.H. (1995). Structure of the human gene encoding sterol regulatory element binding protein-1 (SREBF1) and localization of SREBF1 and SREBF2 to chromosomes 17p11.2 and 22q13. Genomics. 25: 667—673. PMID 7759101 doi:10.1016/0888-7543(95)80009-B
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane. J. Biol. Chem. 271: 10379—10384. PMID 8626610 doi:10.1074/jbc.271.17.10379
Parraga A., Bellsolell L., Ferre-D'Amare A.R., Burley S.K. (1998). Co-crystal structure of sterol regulatory element binding protein 1a at 2.3-A resolution. Structure. 6: 661—672. PMID 9634703 doi:10.1016/S0969-2126(98)00067-7

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11289 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2018. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2018-10-20 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P36956 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11289 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2018. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2018-10-20 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P36956 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]