| TOX3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TOX3, CAGF9, TNRC9, TOX high mobility group box family member 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 611416 MGI: 3039593 HomoloGene: 18257 GeneCards: TOX3
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| рак молочної залози[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • estrogen response element binding • phosphoprotein binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 16: 52.44 – 52.55 Mb
| Хр. 8: 90.97 – 91.07 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
TOX3 (англ. TOX high mobility group box family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 576 амінокислот, а молекулярна маса — 63 342[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDVRFYPAAA
|
|
GDPASLDFAQ
|
|
CLGYYGYSKF
|
|
GNNNNYMNMA
|
|
EANNAFFAAS
|
| EQTFHTPSLG
|
|
DEEFEIPPIT
|
|
PPPESDPALG
|
|
MPDVLLPFQA
|
|
LSDPLPSQGS
|
| EFTPQFPPQS
|
|
LDLPSITISR
|
|
NLVEQDGVLH
|
|
SSGLHMDQSH
|
|
TQVSQYRQDP
|
| SLIMRSIVHM
|
|
TDAARSGVMP
|
|
PAQLTTINQS
|
|
QLSAQLGLNL
|
|
GGASMPHTSP
|
| SPPASKSATP
|
|
SPSSSINEED
|
|
ADEANRAIGE
|
|
KRAAPDSGKK
|
|
PKTPKKKKKK
|
| DPNEPQKPVS
|
|
AYALFFRDTQ
|
|
AAIKGQNPNA
|
|
TFGEVSKIVA
|
|
SMWDSLGEEQ
|
| KQVYKRKTEA
|
|
AKKEYLKALA
|
|
AYRASLVSKA
|
|
AAESAEAQTI
|
|
RSVQQTLAST
|
| NLTSSLLLNT
|
|
PLSQHGTVSA
|
|
SPQTLQQSLP
|
|
RSIAPKPLTM
|
|
RLPMNQIVTS
|
| VTIAANMPSN
|
|
IGAPLISSMG
|
|
TTMVGSAPST
|
|
QVSPSVQTQQ
|
|
HQMQLQQQQQ
|
| QQQQQMQQMQ
|
|
QQQLQQHQMH
|
|
QQIQQQMQQQ
|
|
HFQHHMQQHL
|
|
QQQQQHLQQQ
|
| INQQQLQQQL
|
|
QQRLQLQQLQ
|
|
HMQHQSQPSP
|
|
RQHSPVASQI
|
|
TSPIPAIGSP
|
| QPASQQHQSQ
|
|
IQSQTQTQVL
|
|
SQVSIF
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|