| POU4F1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| POU4F1, BRN3A, Oct-T1, RDC-1, brn-3A, POU class 4 homeobox 1, ATITHS |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601632 MGI: 102525 HomoloGene: 21255 GeneCards: POU4F1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chromatin binding • single-stranded DNA binding • sequence-specific DNA binding • GTPase binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• neuron projection • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• peripheral nervous system neuron development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • habenula development • аксоноґенеза • trigeminal nerve development • neuron fate specification • ventricular compact myocardium morphogenesis • cell migration in hindbrain • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • negative regulation of transcription elongation by RNA polymerase I • central nervous system neuron differentiation • neuron differentiation • positive regulation of apoptotic process • synapse assembly • peripheral nervous system neuron differentiation • mesoderm development • іннервація • proprioception involved in equilibrioception • regulation of neurogenesis • sensory system development • suckling behavior • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:1901313 positive regulation of gene expression • neuron projection development • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of programmed cell death • positive regulation of osteoclast differentiation • regulation of DNA-binding transcription factor activity • cellular response to cytokine stimulus • cellular response to estradiol stimulus • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • development of the heart • negative regulation of gene expression
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 13: 78.6 – 78.6 Mb
| н/д
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
POU4F1 (англ. POU class 4 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 42 697[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MMSMNSKQPH
|
|
FAMHPTLPEH
|
|
KYPSLHSSSE
|
|
AIRRACLPTP
|
|
PLQSNLFASL
|
| DETLLARAEA
|
|
LAAVDIAVSQ
|
|
GKSHPFKPDA
|
|
TYHTMNSVPC
|
|
TSTSTVPLAH
|
| HHHHHHHHQA
|
|
LEPGDLLDHI
|
|
SSPSLALMAG
|
|
AGGAGAAAGG
|
|
GGAHDGPGGG
|
| GGPGGGGGPG
|
|
GGPGGGGGGG
|
|
PGGGGGGPGG
|
|
GLLGGSAHPH
|
|
PHMHSLGHLS
|
| HPAAAAAMNM
|
|
PSGLPHPGLV
|
|
AAAAHHGAAA
|
|
AAAAAAAGQV
|
|
AAASAAAAVV
|
| GAAGLASICD
|
|
SDTDPRELEA
|
|
FAERFKQRRI
|
|
KLGVTQADVG
|
|
SALANLKIPG
|
| VGSLSQSTIC
|
|
RFESLTLSHN
|
|
NMIALKPILQ
|
|
AWLEEAEGAQ
|
|
REKMNKPELF
|
| NGGEKKRKRT
|
|
SIAAPEKRSL
|
|
EAYFAVQPRP
|
|
SSEKIAAIAE
|
|
KLDLKKNVVR
|
| VWFCNQRQKQ
|
|
KRMKFSATY
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Bhargava A.K., Li Z., Weissman S.M. (1993). Differential expression of four members of the POU family of proteins in activated and phorbol 12-myristate 13-acetate-treated Jurkat T cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 10260—10264. PMID 8234287 doi:10.1073/pnas.90.21.10260
- Calissano M., Latchman D.S. (2003). Functional interaction between the small GTP-binding protein Rin and the N-terminal of Brn-3a transcription factor. Oncogene. 22: 5408—5414. PMID 12934100 doi:10.1038/sj.onc.1206635
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|