| GTF2H2
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| GTF2H2, BTF2, BTF2P44, T-BTF2P44, TFIIH, p44, general transcription factor IIH subunit 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601748 MGI: 1345669 HomoloGene: 1159 GeneCards: GTF2H2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• protein kinase activity • ATP-dependent activity, acting on DNA • protein N-terminus binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • translation factor activity, RNA binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • nucleic acid binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • transcription factor TFIIH holo complex • GO:0000441 transcription factor TFIIH core complex • core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex • клітинне ядро • transcription factor TFIID complex • nuclear speck
|
|---|
| Біологічний процес |
• termination of RNA polymerase I transcription • G protein-coupled receptor internalization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • global genome nucleotide-excision repair • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • nucleotide-excision repair, DNA incision • відгук до ультрафіолету • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • GO:0100026 Репарація ДНК • Біосинтез білків • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • protein phosphorylation • nucleotide-excision repair • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA helicase activity • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 5: 71.03 – 71.07 Mb
| Хр. 13: 100.6 – 100.63 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
GTF2H2 (англ. General transcription factor IIH subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 44 419[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDEEPERTKR
|
|
WEGGYERTWE
|
|
ILKEDESGSL
|
|
KATIEDILFK
|
|
AKRKRVFEHH
|
| GQVRLGMMRH
|
|
LYVVVDGSRT
|
|
MEDQDLKPNR
|
|
LTCTLKLLEY
|
|
FVEEYFDQNP
|
| ISQIGIIVTK
|
|
SKRAEKLTEL
|
|
SGNPRKHITS
|
|
LKKAVDMTCH
|
|
GEPSLYNSLS
|
| IAMQTLKHMP
|
|
GHTSREVLII
|
|
FSSLTTCDPS
|
|
NIYDLIKTLK
|
|
AAKIRVSVIG
|
| LSAEVRVCTV
|
|
LARETGGTYH
|
|
VILDESHYKE
|
|
LLTHHVSPPP
|
|
ASSSSECSLI
|
| RMGFPQHTIA
|
|
SLSDQDAKPS
|
|
FSMAHLDGNT
|
|
EPGLTLGGYF
|
|
CPQCRAKYCE
|
| LPVECKICGL
|
|
TLVSAPHLAR
|
|
SYHHLFPLDA
|
|
FQEIPLEEYN
|
|
GERFCYGCQG
|
| ELKDQHVYVC
|
|
AVCQNVFCVD
|
|
CDVFVHDSLH
|
|
CCPGCIHKIP
|
|
APSGV
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|