GTF2H2

GTF2H2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи GTF2H2, BTF2, BTF2P44, T-BTF2P44, TFIIH, p44, general transcription factor IIH subunit 2
Зовнішні ІД OMIM: 601748 MGI: 1345669 HomoloGene: 1159 GeneCards: GTF2H2
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2966
23894
Ensembl
ENSG00000145736
ENSG00000276910
ENSG00000275045
ENSMUSG00000021639
UniProt
Q13888
Q9JIB4
RefSeq (мРНК)
NM_001515
NM_022011
NM_001360706
RefSeq (білок)
NP_071294
NP_001347635
Локус (UCSC) Хр. 5: 71.03 – 71.07 Mb Хр. 13: 100.6 – 100.63 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GTF2H2 (англ. General transcription factor IIH subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 44 419[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDEEPERTKR WEGGYERTWE ILKEDESGSL KATIEDILFK AKRKRVFEHH
GQVRLGMMRH LYVVVDGSRT MEDQDLKPNR LTCTLKLLEY FVEEYFDQNP
ISQIGIIVTK SKRAEKLTEL SGNPRKHITS LKKAVDMTCH GEPSLYNSLS
IAMQTLKHMP GHTSREVLII FSSLTTCDPS NIYDLIKTLK AAKIRVSVIG
LSAEVRVCTV LARETGGTYH VILDESHYKE LLTHHVSPPP ASSSSECSLI
RMGFPQHTIA SLSDQDAKPS FSMAHLDGNT EPGLTLGGYF CPQCRAKYCE
LPVECKICGL TLVSAPHLAR SYHHLFPLDA FQEIPLEEYN GERFCYGCQG
ELKDQHVYVC AVCQNVFCVD CDVFVHDSLH CCPGCIHKIP APSGV

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 doi:10.1074/jbc.273.51.34444
  • Tremeau-Bravard A., Perez C., Egly J.-M. (2001). A role of the C-terminal part of p44 in the promoter escape activity of transcription factor IIH. J. Biol. Chem. 276: 27693—27697. PMID 11319235 doi:10.1074/jbc.M102457200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4656 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 31 серпня 2017. [Архівовано 2016-04-03 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, Q13888 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також