SOX17

SOX17
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SOX17, VUR3, SRY-box 17, SRY-box transcription factor 17
Зовнішні ІД OMIM: 610928 MGI: 107543 HomoloGene: 7948 GeneCards: SOX17
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
64321
20671
Ensembl
ENSG00000164736
ENSMUSG00000025902
UniProt
Q9H6I2
Q61473
RefSeq (мРНК)
NM_022454
NM_001289464
NM_001289465
NM_001289466
NM_001289467
NM_011441
RefSeq (білок)
NP_071899
NP_001276393
NP_001276394
NP_001276395
NP_001276396
NP_035571
Локус (UCSC) Хр. 8: 54.46 – 54.46 Mb Хр. 1: 4.56 – 4.57 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SOX17 (англ. SRY-box 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 44 117[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSSPDAGYAS DDQSQTQSAL PAVMAGLGPC PWAESLSPIG DMKVKGEAPA
NSGAPAGAAG RAKGESRIRR PMNAFMVWAK DERKRLAQQN PDLHNAELSK
MLGKSWKALT LAEKRPFVEE AERLRVQHMQ DHPNYKYRPR RRKQVKRLKR
VEGGFLHGLA EPQAAALGPE GGRVAMDGLG LQFPEQGFPA GPPLLPPHMG
GHYRDCQSLG APPLDGYPLP TPDTSPLDGV DPDPAFFAAP MPGDCPAAGT
YSYAQVSDYA GPPEPPAGPM HPRLGPEPAG PSIPGLLAPP SALHVYYGAM
GSPGAGGGRG FQMQPQHQHQ HQHQHHPPGP GQPSPPPEAL PCRDGTDPSQ
PAELLGEVDR TEFEQYLHFV CKPEMGLPYQ GHDSGVNLPD SHGAISSVVS
DASSAVYYCN YPDV

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Katoh M. (2002). Molecular cloning and characterization of human SOX17. Int. J. Mol. Med. 9: 153—157. PMID 11786926

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18122 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-15 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, Q9H6I2 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також