NFKB1

NFKB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MDI, 1MDJ, 1MDK, 1NFI, 1SVC, 2DBF, 2O61, 3GUT
Ідентифікатори
Символи	NFKB1, EBP-1, KBF1, NF-kB1, NF-kappa-B, NF-kappaB, NFKB-p105, NFKB-p50, NFkappaB, p105, p50, CVID12, nuclear factor kappa B subunit 1, NF-kappa-B1, NF-kB, NF-kappabeta
Зовнішні ІД	OMIM: 164011 MGI: 97312 HomoloGene: 2971 GeneCards: NFKB1
Пов'язані генетичні захворювання
	шизофренія, immunodeficiency, common variable, 12
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • protein homodimerization activity; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • actinin binding; • identical protein binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мітохондрія; • клітинне ядро; • I-kappaB/NF-kappaB complex; • нуклеоплазма; • extracellular region; • гіалоплазма; • secretory granule lumen; • specific granule lumen;
Біологічний процес	• cellular response to interleukin-6; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of vitamin D biosynthetic process; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • cellular response to mechanical stimulus; • NIK/NF-kappaB signaling; • stress-activated MAPK cascade; • negative regulation of inflammatory response; • GO:0097285 апоптоз; • response to muscle stretch; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • negative regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity; • positive regulation of hyaluronan biosynthetic process; • membrane protein intracellular domain proteolysis; • inflammatory response; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of miRNA metabolic process; • cellular response to nicotine; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • negative regulation of cholesterol transport; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0032697 negative regulation of cytokine production; • positive regulation of lipid storage; • cellular response to dsRNA; • T cell receptor signaling pathway; • positive regulation of type I interferon production; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • cellular response to lipopolysaccharide; • cellular response to interleukin-1; • вроджений імунітет; • negative regulation of apoptotic process; • negative regulation of gene expression; • neutrophil degranulation; • cellular response to tumor necrosis factor; • cellular response to angiotensin; • interleukin-1-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4790
	18033
	ENSG00000109320
	ENSMUSG00000028163
	P19838
	P25799
NM_001165412; NM_003998; NM_001319226; NM_001382625; NM_001382626;
	NM_001382627; NM_001382628
	NM_008689
NP_001158884; NP_001306155; NP_003989; NP_001369554; NP_001369555;
	NP_001369556; NP_001369557; NP_001158884.1; NP_001306155.1
	NP_032715
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NFKB1 (англ. Nuclear factor kappa B subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 968 амінокислот, а молекулярна маса — 105 356^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEDDPYLGR	PEQMFHLDPS	LTHTIFNPEV	FQPQMALPTD	GPYLQILEQP
KQRGFRFRYV	CEGPSHGGLP	GASSEKNKKS	YPQVKICNYV	GPAKVIVQLV
TNGKNIHLHA	HSLVGKHCED	GICTVTAGPK	DMVVGFANLG	ILHVTKKKVF
ETLEARMTEA	CIRGYNPGLL	VHPDLAYLQA	EGGGDRQLGD	REKELIRQAA
LQQTKEMDLS	VVRLMFTAFL	PDSTGSFTRR	LEPVVSDAIY	DSKAPNASNL
KIVRMDRTAG	CVTGGEEIYL	LCDKVQKDDI	QIRFYEEEEN	GGVWEGFGDF
SPTDVHRQFA	IVFKTPKYKD	INITKPASVF	VQLRRKSDLE	TSEPKPFLYY
PEIKDKEEVQ	RKRQKLMPNF	SDSFGGGSGA	GAGGGGMFGS	GGGGGGTGST
GPGYSFPHYG	FPTYGGITFH	PGTTKSNAGM	KHGTMDTESK	KDPEGCDKSD
DKNTVNLFGK	VIETTEQDQE	PSEATVGNGE	VTLTYATGTK	EESAGVQDNL
FLEKAMQLAK	RHANALFDYA	VTGDVKMLLA	VQRHLTAVQD	ENGDSVLHLA
IIHLHSQLVR	DLLEVTSGLI	SDDIINMRND	LYQTPLHLAV	ITKQEDVVED
LLRAGADLSL	LDRLGNSVLH	LAAKEGHDKV	LSILLKHKKA	ALLLDHPNGD
GLNAIHLAMM	SNSLPCLLLL	VAAGADVNAQ	EQKSGRTALH	LAVEHDNISL
AGCLLLEGDA	HVDSTTYDGT	TPLHIAAGRG	STRLAALLKA	AGADPLVENF
EPLYDLDDSW	ENAGEDEGVV	PGTTPLDMAT	SWQVFDILNG	KPYEPEFTSD
DLLAQGDMKQ	LAEDVKLQLY	KLLEIPDPDK	NWATLAQKLG	LGILNNAFRL
SPAPSKTLMD	NYEVSGGTVR	ELVEALRQMG	YTEAIEVIQA	ASSPVKTTSQ
AHSLPLSPAS	TRQQIDELRD	SDSVCDSGVE	TSFRKLSFTE	SLTSGASLLT
LNKMPHDYGQ	EGPLEGKI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Bours V., Villalobos J., Burd P.R., Kelly K., Siebenlist U. (1990). Cloning of a mitogen-inducible gene encoding a kappa B DNA-binding protein with homology to the rel oncogene and to cell-cycle motifs. Nature. 348: 76—80. PMID 2234062 doi:10.1038/348076a0
Heron E., Deloukas P., van Loon A.P.G.M. (1995). The complete exon-intron structure of the 156-kb human gene NFKB1, which encodes the p105 and p50 proteins of transcription factors NF-kappa B and I kappa B-gamma: implications for NF-kappa B-mediated signal transduction. Genomics. 30: 493—505. PMID 8825636 doi:10.1006/geno.1995.1270
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Palombella V.J., Rando O.J., Goldberg A.L., Maniatis T. (1994). The ubiquitin-proteasome pathway is required for processing the NF-kappa B1 precursor protein and the activation of NF-kappa B. Cell. 78: 773—785. PMID 8087845 doi:10.1016/S0092-8674(94)90482-0
Lin L., Ghosh S. (1996). A glycine-rich region in NF-kappaB p105 functions as a processing signal for the generation of the p50 subunit. Mol. Cell. Biol. 16: 2248—2254. PMID 8628291 doi:10.1128/MCB.16.5.2248
Matthews J.R., Botting C.H., Panico M., Morris H.R., Hay R.T. (1996). Inhibition of NF-kappaB DNA binding by nitric oxide. Nucleic Acids Res. 24: 2236—2242. PMID 8710491 doi:10.1093/nar/24.12.2236

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NFKB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7794 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P19838 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

[1] Захворювання, генетично пов'язані з NFKB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7794 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P19838 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]