USF1

USF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AN4
Ідентифікатори
Символи	USF1, FCHL, FCHL1, HYPLIP1, MLTF, MLTFI, UEF, bHLHb11, upstream transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 191523 MGI: 99542 HomoloGene: 31426 GeneCards: USF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • histone deacetylase binding; • bHLH transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • enzyme binding; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • protein kinase binding; • protein homodimerization activity; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • sequence-specific DNA binding; • identical protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• transcription regulator complex; • клітинне ядро; • NURF complex; • Set1C/COMPASS complex; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• carbon catabolite regulation of transcription; • negative regulation of fibrinolysis; • response to hypoxia; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • glucose homeostasis; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • late viral transcription; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose; • glucose metabolic process; • cellular response to insulin stimulus; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose; • lipid homeostasis; • відгук до ультрафіолету;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7391
	22278
	ENSG00000158773
	ENSMUSG00000026641
	P22415
	Q61069
	NM_207005; NM_001276373; NM_007122
	NM_009480; NM_001305676; NM_001305677; NM_001305678
	NP_001263302; NP_009053; NP_996888
	NP_001292605; NP_001292606; NP_001292607; NP_033506
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

USF1 (англ. Upstream transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 33 538^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKGQQKTAET	EEGTVQIQEG	AVATGEDPTS	VAIASIQSAA	TFPDPNVKYV
FRTENGGQVM	YRVIQVSEGQ	LDGQTEGTGA	ISGYPATQSM	TQAVIQGAFT
SDDAVDTEGT	AAETHYTYFP	STAVGDGAGG	TTSGSTAAVV	TTQGSEALLG
QATPPGTGQF	FVMMSPQEVL	QGGSQRSIAP	RTHPYSPKSE	APRTTRDEKR
RAQHNEVERR	RRDKINNWIV	QLSKIIPDCS	MESTKSGQSK	GGILSKACDY
IQELRQSNHR	LSEELQGLDQ	LQLDNDVLRQ	QVEDLKNKNL	LLRAQLRHHG
LEVVIKNDSN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Gregor P.D., Sawadogo M., Roeder R.G. (1990). The adenovirus major late transcription factor USF is a member of the helix-loop-helix group of regulatory proteins and binds to DNA as a dimer. Genes Dev. 4: 1730—1740. PMID 2249772 doi:10.1101/gad.4.10.1730
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Rahaus M., Desloges N., Yang M., Ruyechan W.T., Wolff M.H. (2003). Transcription factor USF, expressed during the entire phase of Varicella-zoster virus infection, interacts physically with the major viral transactivator IE62 and plays a significant role in virus replication. J. Gen. Virol. 84: 2957—2967. PMID 14573800 doi:10.1099/vir.0.19335-0
Ferre-D'Amare A.R., Pognonec P., Roeder R.G., Burley S.K. (1994). Structure and function of the b/HLH/Z domain of USF. EMBO J. 13: 180—189. PMID 8306960

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12593 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P22415 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12593 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P22415 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]