HOXB13

HOXB13
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CRA
Ідентифікатори
Символи	HOXB13, PSGD, homeobox B13, HPC9
Зовнішні ІД	OMIM: 604607 MGI: 107730 HomoloGene: 4640 GeneCards: HOXB13
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • methyl-CpG binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • transcription regulator complex; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• response to testosterone; • morphogenesis of an epithelium; • multicellular organism development; • regulation of growth; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • response to wounding; • prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis; • Ангіогенез; • transcription, DNA-templated; • epithelial cell maturation involved in prostate gland development; • epidermis development; • prostate gland development; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10481
	15408
	ENSG00000159184
	ENSMUSG00000049604
	Q92826
	P70321
	NM_006361
	NM_008267
	NP_006352
	NP_032293
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXB13 (англ. Homeobox B13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 30 676^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPGNYATLD	GAKDIEGLLG	AGGGRNLVAH	SPLTSHPAAP	TLMPAVNYAP
LDLPGSAEPP	KQCHPCPGVP	QGTSPAPVPY	GYFGGGYYSC	RVSRSSLKPC
AQAATLAAYP	AETPTAGEEY	PSRPTEFAFY	PGYPGTYQPM	ASYLDVSVVQ
TLGAPGEPRH	DSLLPVDSYQ	SWALAGGWNS	QMCCQGEQNP	PGPFWKAAFA
DSSGQHPPDA	CAFRRGRKKR	IPYSKGQLRE	LEREYAANKF	ITKDKRRKIS
AATSLSERQI	TIWFQNRRVK	EKKVLAKVKN	SATP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Breyer J.P., Avritt T.G., McReynolds K.M., Dupont W.D., Smith J.R. (2012). Confirmation of the HOXB13 G84E germline mutation in familial prostate cancer. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 21: 1348—1353. PMID 22714738 doi:10.1158/1055-9965.EPI-12-0495
Zeltser L.M., Desplan C., Heintz N. (1996). Hoxb-13: a new Hox gene in a distant region of the HOXB cluster maintains colinearity. Development. 122: 2475—2484. PMID 8756292

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5112 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q92826 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5112 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q92826 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]