PHF20

PHF20
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3P8D, 3Q1J, 3QII, 3SD4
Ідентифікатори
Символи	PHF20, C20orf104, GLEA2, HCA58, NZF, TDRD20A, TZP, PHD finger protein 20
Зовнішні ІД	OMIM: 610335 MGI: 2444148 HomoloGene: 9507 GeneCards: PHF20
Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific); • DNA binding; • histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific); • зв’язування з іоном металу; • histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific); • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• ядерна мембрана; • histone acetyltransferase complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • MLL1 complex;
Біологічний процес	• histone H4-K16 acetylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • histone H4-K5 acetylation; • histone H4-K8 acetylation; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	51230
	228829
	ENSG00000025293
	ENSMUSG00000038116
	Q9BVI0; Q5JWZ0
	Q8BLG0
	NM_016436
	NM_172674
	NP_057520
	NP_766262
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PHF20 (англ. PHD finger protein 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 012 амінокислот, а молекулярна маса — 115 386^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTKHPPNRRG	ISFEVGAQLE	ARDRLKNWYP	AHIEDIDYEE	GKVLIHFKRW
NHRYDEWFCW	DSPYLRPLEK	IQLRKEGLHE	EDGSSEFQIN	EQVLACWSDC
RFYPAKVTAV	NKDGTYTVKF	YDGVVQTVKH	IHVKAFSKDQ	NIVGNARPKE
TDHKSLSSSP	DKREKFKEQR	KATVNVKKDK	EDKPLKTEKR	PKQPDKEGKL
ICSEKGKVSE	KSLPKNEKED	KENISENDRE	YSGDAQVDKK	PENDIVKSPQ
ENLREPKRKR	GRPPSIAPTA	VDSNSQTLQP	ITLELRRRKI	SKGCEVPLKR
PRLDKNSSQE	KSKNYSENTD	KDLSRRRSSR	LSTNGTHEIL	DPDLVVSDLV
DTDPLQDTLS	STKESEEGQL	KSALEAGQVS	SALTCHSFGD	GSGAAGLELN
CPSMGENTMK	TEPTSPLVEL	QEISTVEVTN	TFKKTDDFGS	SNAPAVDLDH
KFRCKVVDCL	KFFRKAKLLH	YHMKYFHGME	KSLEPEESPG	KRHVQTRGPS
ASDKPSQETL	TRKRVSASSP	TTKDKEKNKE	KKFKEFVRVK	PKKKKKKKKK
TKPECPCSEE	ISDTSQEPSP	PKAFAVTRCG	SSHKPGVHMS	PQLHGPESGH
HKGKVKALEE	DNLSESSSES	FLWSDDEYGQ	DVDVTTNPDE	ELDGDDRYDF
EVVRCICEVQ	EENDFMIQCE	ECQCWQHGVC	MGLLEENVPE	KYTCYVCQDP
PGQRPGFKYW	YDKEWLSRGH	MHGLAFLEEN	YSHQNAKKIV	ATHQLLGDVQ
RVIEVLHGLQ	LKMSILQSRE	HPDLPLWCQP	WKQHSGEGRS	HFRNIPVTDT
RSKEEAPSYR	TLNGAVEKPR	PLALPLPRSV	EESYITSEHC	YQKPRAYYPA
VEQKLVVETR	GSALDDAVNP	LHENGDDSLS	PRLGWPLDQD	RSKGDSDPKP
GSPKVKEYVS	KKALPEEAPA	RKLLDRGGEG	LLSSQHQWQF	NLLTHVESLQ
DEVTHRMDSI	EKELDVLESW	LDYTGELEPP	EPLARLPQLK	HCIKQLLMDL
GKVQQIALCC	ST

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16098 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BVI0 (англ.) . Архів оригіналу за 17 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16098 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9BVI0 (англ.) . Архів оригіналу за 17 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]