| CEBPE
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| CEBPE, C/EBP-epsilon, CRP1, CCAAT/enhancer binding protein epsilon, CCAAT enhancer binding protein epsilon, c/EBP epsilon |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600749 MGI: 103572 HomoloGene: 1367 GeneCards: CEBPE
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Гострий лімфобластний лейкоз, lymphoblastic leukemia[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• protein heterodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• defense response • myeloid cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cellular response to lipopolysaccharide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • defense response to bacterium • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • macrophage differentiation • Фагоцитоз • transcription by RNA polymerase II • granulocyte differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 23.12 – 23.12 Mb
| Хр. 14: 54.95 – 54.95 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
CEBPE (англ. CCAAT/enhancer binding protein epsilon) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 281 амінокислот, а молекулярна маса — 30 603[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSHGTYYECE
|
|
PRGGQQPLEF
|
|
SGGRAGPGEL
|
|
GDMCEHEASI
|
|
DLSAYIESGE
|
| EQLLSDLFAV
|
|
KPAPEARGLK
|
|
GPGTPAFPHY
|
|
LPPDPRPFAY
|
|
PPHTFGPDRK
|
| ALGPGIYSSP
|
|
GSYDPRAVAV
|
|
KEEPRGPEGS
|
|
RAASRGSYNP
|
|
LQYQVAHCGQ
|
| TAMHLPPTLA
|
|
APGQPLRVLK
|
|
APLATAAPPC
|
|
SPLLKAPSPA
|
|
GPLHKGKKAV
|
| NKDSLEYRLR
|
|
RERNNIAVRK
|
|
SRDKAKRRIL
|
|
ETQQKVLEYM
|
|
AENERLRSRV
|
| EQLTQELDTL
|
|
RNLFRQIPEA
|
|
ANLIKGVGGC
|
|
S
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Antonson P., Stellan B., Yamanaka R., Xanthopoulos K.G. (1996). A novel human CCAAT/enhancer binding protein gene, C/EBPepsilon, is expressed in cells of lymphoid and myeloid lineages and is localized on chromosome 14q11.2 close to the T-cell receptor alpha/delta locus. Genomics. 35: 30—38. PMID 8661101 doi:10.1006/geno.1996.0319
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|