| POU1F1
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| POU1F1, CPHD1, GHF-1, PIT1, POU1F1a, Pit-1, POU class 1 homeobox 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 173110 MGI: 97588 HomoloGene: 259 GeneCards: POU1F1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| гіпопітуїтаризм[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • transcription regulator complex • хроматин
|
|---|
| Біологічний процес |
• negative regulation of cell population proliferation • somatotropin secreting cell development • adenohypophysis development • positive regulation of inositol trisphosphate biosynthetic process • regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cell fate specification • B cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • determination of adult lifespan • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of multicellular organism growth • nuclear transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • somatotropin secreting cell differentiation • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 3: 87.26 – 87.28 Mb
| Хр. 16: 65.32 – 65.33 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
POU1F1 (англ. POU class 1 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 912[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSCQAFTSAD
|
|
TFIPLNSDAS
|
|
ATLPLIMHHS
|
|
AAECLPVSNH
|
|
ATNVMSTATG
|
| LHYSVPSCHY
|
|
GNQPSTYGVM
|
|
AGSLTPCLYK
|
|
FPDHTLSHGF
|
|
PPIHQPLLAE
|
| DPTAADFKQE
|
|
LRRKSKLVEE
|
|
PIDMDSPEIR
|
|
ELEKFANEFK
|
|
VRRIKLGYTQ
|
| TNVGEALAAV
|
|
HGSEFSQTTI
|
|
CRFENLQLSF
|
|
KNACKLKAIL
|
|
SKWLEEAEQV
|
| GALYNEKVGA
|
|
NERKRKRRTT
|
|
ISIAAKDALE
|
|
RHFGEQNKPS
|
|
SQEIMRMAEE
|
| LNLEKEVVRV
|
|
WFCNRRQREK
|
|
RVKTSLNQSL
|
|
FSISKEHLEC
|
|
R
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Lew A.M., Elsholtz H.P. (1991). Cloning of the human cDNA for transcription factor Pit-1. Nucleic Acids Res. 19: 6329—6329. PMID 1956794 doi:10.1093/nar/19.22.6329
- Tatsumi K.I., Notomi T., Amino N., Miyai K. (1992). Nucleotide sequence of the complementary DNA for human Pit-1/GHF-1. Biochim. Biophys. Acta. 1129: 231—234. PMID 1370379 doi:10.1016/0167-4781(92)90494-K
- Delhase M., Vila V., Hooghe-Peters E.L., Castrillo J.-L. (1995). A novel pituitary transcription factor is produced by alternative splicing of the human GHF-1/PIT-1 gene. Gene. 155: 273—275. PMID 7721104 doi:10.1016/0378-1119(94)00757-J
- Pernasetti F.M., Wera S., Belayew A., Martial J.A. (1993). Cloning of a human GHF-1/Pit-1 cDNA variant. Nucleic Acids Res. 21: 3584—3584. PMID 8346040 doi:10.1093/nar/21.15.3584
- Turton J.P., Strom M., Langham S., Dattani M.T., Le Tissier P. (2012). Two novel mutations in the POU1F1 gene generate null alleles through different mechanisms leading to c ombined pituitary hormone deficiency. Clin. Endocrinol. (Oxf.). 76: 387—393. PMID 22010633 doi:10.1111/j.1365-2265.2011.04236.x
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|