| NR1H3
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| NR1H3, LXR-a, LXRA, RLD-1, Liver X receptor alpha, nuclear receptor subfamily 1 group H member 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602423 MGI: 1352462 HomoloGene: 21165 GeneCards: NR1H3
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| метаболічні захворювання[1] |
|
|
| Реагує на сполуку |
|---|
| (25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• cholesterol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • sterol response element binding • steroid hormone receptor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• receptor complex • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • sterol homeostasis • negative regulation of pancreatic juice secretion • negative regulation of inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of lipid transport • positive regulation of lipoprotein lipase activity • lipid homeostasis • triglyceride homeostasis • negative regulation of macrophage activation • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of cholesterol transport • negative regulation of cholesterol storage • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of triglyceride biosynthetic process • positive regulation of cholesterol efflux • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • regulation of circadian rhythm • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to progesterone • steroid hormone mediated signaling pathway • apoptotic cell clearance • positive regulation of fatty acid biosynthetic process • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of secretion of lysosomal enzymes • negative regulation of pinocytosis • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • intracellular receptor signaling pathway • cholesterol homeostasis • Обмін жирів • multicellular organism development • диференціація клітин • negative regulation of cold-induced thermogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 11: 47.25 – 47.27 Mb
| Хр. 2: 91.01 – 91.03 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[3]
| [4] |
|---|
| Вікідані |
|
NR1H3 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 447 амінокислот, а молекулярна маса — 50 396[6].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSLWLGAPVP
|
|
DIPPDSAVEL
|
|
WKPGAQDASS
|
|
QAQGGSSCIL
|
|
REEARMPHSA
|
| GGTAGVGLEA
|
|
AEPTALLTRA
|
|
EPPSEPTEIR
|
|
PQKRKKGPAP
|
|
KMLGNELCSV
|
| CGDKASGFHY
|
|
NVLSCEGCKG
|
|
FFRRSVIKGA
|
|
HYICHSGGHC
|
|
PMDTYMRRKC
|
| QECRLRKCRQ
|
|
AGMREECVLS
|
|
EEQIRLKKLK
|
|
RQEEEQAHAT
|
|
SLPPRASSPP
|
| QILPQLSPEQ
|
|
LGMIEKLVAA
|
|
QQQCNRRSFS
|
|
DRLRVTPWPM
|
|
APDPHSREAR
|
| QQRFAHFTEL
|
|
AIVSVQEIVD
|
|
FAKQLPGFLQ
|
|
LSREDQIALL
|
|
KTSAIEVMLL
|
| ETSRRYNPGS
|
|
ESITFLKDFS
|
|
YNREDFAKAG
|
|
LQVEFINPIF
|
|
EFSRAMNELQ
|
| LNDAEFALLI
|
|
AISIFSADRP
|
|
NVQDQLQVER
|
|
LQHTYVEALH
|
|
AYVSIHHPHD
|
| RLMFPRMLMK
|
|
LVSLRTLSSV
|
|
HSEQVFALRL
|
|
QDKKLPPLLS
|
|
EIWDVHE
|
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|