SOX1

SOX1
Ідентифікатори
Символи	SOX1, SRY-box 1, SRY-box transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602148 MGI: 98357 HomoloGene: 133765 GeneCards: SOX1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• forebrain neuron development; • ventral spinal cord interneuron specification; • forebrain development; • neuron migration; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • lens morphogenesis in camera-type eye; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • нейробіологія розвитку; • forebrain neuron differentiation; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • диференціація клітин; • central nervous system development; • neuron differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6656
	20664
	ENSG00000182968
	ENSMUSG00000096014
	O00570
	P53783
	NM_005986
	NM_009233
	NP_005977
	NP_033259
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SOX1 (англ. SRY-box 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислоту, а молекулярна маса — 39 023^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYSMMMETDL	HSPGGAQAPT	NLSGPAGAGG	GGGGGGGGGG	GGGAKANQDR
VKRPMNAFMV	WSRGQRRKMA	QENPKMHNSE	ISKRLGAEWK	VMSEAEKRPF
IDEAKRLRAL	HMKEHPDYKY	RPRRKTKTLL	KKDKYSLAGG	LLAAGAGGGG
AAVAMGVGVG	VGAAAVGQRL	ESPGGAAGGG	YAHVNGWANG	AYPGSVAAAA
AAAAMMQEAQ	LAYGQHPGAG	GAHPHAHPAH	PHPHHPHAHP	HNPQPMHRYD
MGALQYSPIS	NSQGYMSASP	SGYGGLPYGA	AAAAAAAAGG	AHQNSAVAAA
AAAAAASSGA	LGALGSLVKS	EPSGSPPAPA	HSRAPCPGDL	REMISMYLPA
GEGGDPAAAA	AAAAQSRLHS	LPQHYQGAGA	GVNGTVPLTH	I

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Malas S., Duthie S.M., Mohri F., Lovell-Badge R., Episkopou V. (1997). Cloning and mapping of the human SOX1: a highly conserved gene expressed in the developing brain. Mamm. Genome. 8: 866—868. PMID 9337405 doi:10.1007/s003359900597

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11189 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-06 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O00570 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11189 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-06 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O00570 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]