| SOX11
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SOX11, MRD27, SRY-box 11, CSS9, SRY-box transcription factor 11 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600898 MGI: 98359 HomoloGene: 37733 GeneCards: SOX11
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 27[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • translation factor activity, RNA binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • skeletal system development • noradrenergic neuron differentiation • positive regulation of lens epithelial cell proliferation • диференціація клітин • cardiac ventricle formation • glial cell development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • limb bud formation • lung morphogenesis • sympathetic nervous system development • neural crest cell development • розвиток нирки • negative regulation of glial cell proliferation • soft palate development • ventricular septum morphogenesis • cornea development in camera-type eye • outflow tract morphogenesis • positive regulation of ossification • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell death • transcription by RNA polymerase II • eyelid development in camera-type eye • negative regulation of gene expression • negative regulation of lymphocyte proliferation • somite development • transcription, DNA-templated • neuroepithelial cell differentiation • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of hippo signaling • positive regulation of neurogenesis • multicellular organism development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of osteoblast differentiation • lens morphogenesis in camera-type eye • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • hard palate development • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • positive regulation of cell population proliferation • spinal cord development • positive regulation of BMP signaling pathway • glial cell proliferation • skeletal muscle cell differentiation • embryonic digestive tract morphogenesis • oligodendrocyte development • проліферація • positive regulation of stem cell proliferation • neural tube formation • positive regulation of hormone secretion • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • closure of optic fissure • Біосинтез білків
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 5.69 – 5.7 Mb
| Хр. 12: 27.38 – 27.39 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
SOX11 (англ. SRY-box 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 46 679[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MVQQAESLEA
|
|
ESNLPREALD
|
|
TEEGEFMACS
|
|
PVALDESDPD
|
|
WCKTASGHIK
|
| RPMNAFMVWS
|
|
KIERRKIMEQ
|
|
SPDMHNAEIS
|
|
KRLGKRWKML
|
|
KDSEKIPFIR
|
| EAERLRLKHM
|
|
ADYPDYKYRP
|
|
RKKPKMDPSA
|
|
KPSASQSPEK
|
|
SAAGGGGGSA
|
| GGGAGGAKTS
|
|
KGSSKKCGKL
|
|
KAPAAAGAKA
|
|
GAGKAAQSGD
|
|
YGGAGDDYVL
|
| GSLRVSGSGG
|
|
GGAGKTVKCV
|
|
FLDEDDDDDD
|
|
DDDELQLQIK
|
|
QEPDEEDEEP
|
| PHQQLLQPPG
|
|
QQPSQLLRRY
|
|
NVAKVPASPT
|
|
LSSSAESPEG
|
|
ASLYDEVRAG
|
| ATSGAGGGSR
|
|
LYYSFKNITK
|
|
QHPPPLAQPA
|
|
LSPASSRSVS
|
|
TSSSSSSGSS
|
| SGSSGEDADD
|
|
LMFDLSLNFS
|
|
QSAHSASEQQ
|
|
LGGGAAAGNL
|
|
SLSLVDKDLD
|
| SFSEGSLGSH
|
|
FEFPDYCTPE
|
|
LSEMIAGDWL
|
|
EANFSDLVFT
|
|
Y
|
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|