| NFE2L1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| NFE2L1, LCR-F1, NRF1, TCF11, nuclear factor, erythroid 2 like 1, NRF-1, NFE2 like bZIP transcription factor 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 163260 MGI: 99421 HomoloGene: 20685 GeneCards: NFE2L1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • cholesterol binding • protein heterodimerization activity • lipid binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • promoter-specific chromatin binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • integral component of endoplasmic reticulum membrane • GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • heme biosynthetic process • erythrocyte differentiation • inflammatory response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cellular response to oxidative stress • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • cell redox homeostasis • lipid homeostasis • cellular response to cholesterol • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • regulation of odontoblast differentiation • Обмін жирів • steroid metabolic process • cholesterol metabolic process • cholesterol homeostasis • protein polyubiquitination • fructose 6-phosphate metabolic process • glutathione metabolic process • regulation of mitotic nuclear division • регуляція експресії генів • regulation of glucose metabolic process • regulation of lipid metabolic process • regulation of fatty acid metabolic process • cellular homeostasis • spinal cord motor neuron differentiation • glial cell fate commitment • response to endoplasmic reticulum stress • cysteine transport • regulation of inflammatory response • glucose 6-phosphate metabolic process • regulation of proteasomal protein catabolic process • cellular response to cold • regulation of nucleus organization • regulation of response to endoplasmic reticulum stress
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 48.05 – 48.06 Mb
| Хр. 11: 96.71 – 96.72 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
NFE2L1 (англ. Nuclear factor, erythroid 2 like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 772 амінокислот, а молекулярна маса — 84 704[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLSLKKYLTE
|
|
GLLQFTILLS
|
|
LIGVRVDVDT
|
|
YLTSQLPPLR
|
|
EIILGPSSAY
|
| TQTQFHNLRN
|
|
TLDGYGIHPK
|
|
SIDLDNYFTA
|
|
RRLLSQVRAL
|
|
DRFQVPTTEV
|
| NAWLVHRDPE
|
|
GSVSGSQPNS
|
|
GLALESSSGL
|
|
QDVTGPDNGV
|
|
RESETEQGFG
|
| EDLEDLGAVA
|
|
PPVSGDLTKE
|
|
DIDLIDILWR
|
|
QDIDLGAGRE
|
|
VFDYSHRQKE
|
| QDVEKELRDG
|
|
GEQDTWAGEG
|
|
AEALARNLLV
|
|
DGETGESFPA
|
|
QVPSGEDQTA
|
| LSLEECLRLL
|
|
EATCPFGENA
|
|
EFPADISSIT
|
|
EAVPSESEPP
|
|
ALQNNLLSPL
|
| LTGTESPFDL
|
|
EQQWQDLMSI
|
|
MEMQAMEVNT
|
|
SASEILYSAP
|
|
PGDPLSTNYS
|
| LAPNTPINQN
|
|
VSLHQASLGG
|
|
CSQDFLLFSP
|
|
EVESLPVASS
|
|
STLLPLAPSN
|
| STSLNSTFGS
|
|
TNLTGLFFPP
|
|
QLNGTANDTA
|
|
GPELPDPLGG
|
|
LLDEAMLDEI
|
| SLMDLAIEEG
|
|
FNPVQASQLE
|
|
EEFDSDSGLS
|
|
LDSSHSPSSL
|
|
SSSEGSSSSS
|
| SSSSSSSSSA
|
|
SSSASSSFSE
|
|
EGAVGYSSDS
|
|
ETLDLEEAEG
|
|
AVGYQPEYSK
|
| FCRMSYQDPA
|
|
QLSCLPYLEH
|
|
VGHNHTYNMA
|
|
PSALDSADLP
|
|
PPSALKKGSK
|
| EKQADFLDKQ
|
|
MSRDEHRARA
|
|
MKIPFTNDKI
|
|
INLPVEEFNE
|
|
LLSKYQLSEA
|
| QLSLIRDIRR
|
|
RGKNKMAAQN
|
|
CRKRKLDTIL
|
|
NLERDVEDLQ
|
|
RDKARLLREK
|
| VEFLRSLRQM
|
|
KQKVQSLYQE
|
|
VFGRLRDENG
|
|
RPYSPSQYAL
|
|
QYAGDGSVLL
|
| IPRTMADQQA
|
|
RRQERKPKDR
|
|
RK
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Chan J.Y., Han X.-L., Kan Y.W. (1993). Cloning of Nrf1, an NF-E2-related transcription factor, by genetic selection in yeast. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 11371—11375. PMID 8248256 doi:10.1073/pnas.90.23.11371
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Caterina J.J., Donze D., Sun C.W., Ciavatta D.J., Townes T.M. (1994). Cloning and functional characterization of LCR-F1: a bZIP transcription factor that activates erythroid-specific, human globin gene expression. Nucleic Acids Res. 22: 2383—2391. PMID 8036168 doi:10.1093/nar/22.12.2383
- Wang W., Chan J.Y. (2006). Nrf1 is targeted to the endoplasmic reticulum membrane by an N-terminal transmembrane domain. Inhibition of nuclear translocation and transacting function. J. Biol. Chem. 281: 19676—19687. PMID 16687406 doi:10.1074/jbc.M602802200
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|