| HOXB4
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXB4, HOX-2.6, HOX2, HOX2F, homeobox B4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142965 MGI: 96185 HomoloGene: 32095 GeneCards: HOXB4
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • центросома
|
|---|
| Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • definitive hemopoiesis • somatic stem cell division • skeletal system morphogenesis • проліферація • positive regulation of stem cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • spleen development • hematopoietic stem cell differentiation • morphogenesis of an epithelial sheet • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • bone marrow development • кровотворення • skeletal system development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 48.58 – 48.58 Mb
| Хр. 11: 96.21 – 96.21 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXB4 (англ. Homeobox B4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 251 амінокислот, а молекулярна маса — 27 604[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAMSSFLINS
|
|
NYVDPKFPPC
|
|
EEYSQSDYLP
|
|
SDHSPGYYAG
|
|
GQRRESSFQP
|
| EAGFGRRAAC
|
|
TVQRYAACRD
|
|
PGPPPPPPPP
|
|
PPPPPPPGLS
|
|
PRAPAPPPAG
|
| ALLPEPGQRC
|
|
EAVSSSPPPP
|
|
PCAQNPLHPS
|
|
PSHSACKEPV
|
|
VYPWMRKVHV
|
| STVNPNYAGG
|
|
EPKRSRTAYT
|
|
RQQVLELEKE
|
|
FHYNRYLTRR
|
|
RRVEIAHALC
|
| LSERQIKIWF
|
|
QNRRMKWKKD
|
|
HKLPNTKIRS
|
|
GGAAGSAGGP
|
|
PGRPNGGPRA
|
| L
|
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|